cBioPortal:腺样囊性癌(FMI,美国外科病理学杂志2014)

腺样囊性癌是发生在唾液腺等部位的一类恶性肿瘤,临床上可出现局部复发与远处转移,转移性病例的治疗选择相对有限,因此对这类肿瘤的分子特征进行刻画具有一定的研究价值

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基因组acyc
cBioPortal: Adenoid Cystic Carcinoma (FMI, Am J Surg Pathl. 2014)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

cBioPortal:腺样囊性癌(FMI,美国外科病理学杂志2014)

该数据集是 cBioPortal 平台收录的一项腺样囊性癌(Adenoid Cystic Carcinoma)研究,由 FMI 完成,成果发表于 2014 年的《American Journal of Surgical Pathology》,其核心内容是对 28 例转移性腺样囊性癌样本进行靶向测序。

【数据集背景】

腺样囊性癌是发生在唾液腺等部位的一类恶性肿瘤,临床上可出现局部复发与远处转移,转移性病例的治疗选择相对有限,因此对这类肿瘤的分子特征进行刻画具有一定的研究价值。以上为腺样囊性癌的一般性背景。就本数据集而言,源站给出的标题为“Adenoid Cystic Carcinoma (FMI, Am J Surg Pathl. 2014)”,本站收录后在其前方加上了平台标识“cBioPortal:”,形成完整名称。标题中出现的 FMI 与 Am J Surg Pathl. 2014 分别指向研究相关的机构标识以及发表的期刊与年份,其中 FMI 的具体全称源站未提供。该数据集在站内被划入“肿瘤 / 其他”分类,并带有 acyc 这一主题标识。研究工作的立项背景、研究假设与既往研究脉络,源站未提供。

【数据内容】

源站描述表明,该数据集包含针对 28 个转移性腺样囊性癌样本的靶向测序。也就是说,样本类型为转移性病灶来源,检测策略为靶向测序而非全基因组或全外显子测序,样本规模为 28 例。除这一概括性说明之外,所检测的具体基因或 panel 组成、覆盖区域、测序深度、检出的变异类型(如点突变、插入缺失、拷贝数改变、基因融合等)、每个样本的临床注释信息以及配套的临床结局字段,源站均未提供。

【采集与来源】

数据集通过 cbioportal.org 发布,原始研究工作由 FMI 完成,并以“Adenoid Cystic Carcinoma (FMI, Am J Surg Pathl. 2014)”为题对外呈现。关于样本的采集地点、采集时间跨度、患者入组标准、样本处理与保存流程、伦理审查与知情同意安排等,源站未提供。

【适用场景】

从已披露的信息看,该数据集适合用于转移性腺样囊性癌的靶向测序数据分析场景,例如围绕该病种的体细胞变异谱开展探索性研究,或与其他腺样囊性癌队列进行比较与整合分析。由于样本量有限且全部为转移性样本,它更适合作为特定研究问题的辅助证据来源,而不宜用于估计一般人群或原发肿瘤中的突变频率。源站未就本数据集推荐的具体分析场景、配套分析流程或预期用途作出说明。

【使用方法】

源站未提供本数据集的使用说明,包括访问路径、下载格式、文件组织结构、字段字典以及分析工具推荐等。cBioPortal 作为公共癌症基因组学平台,通常以网页浏览与数据下载的方式向研究者开放数据,但针对本数据集的具体操作方式、是否需要注册或申请、可否用于再分析等信息,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供质控指标,例如测序深度、覆盖均一性、样本合格判定标准或数据完整性说明。就已披露的信息而言,需要关注两点:其一,样本规模为 28 例,属于较小的队列;其二,纳入的样本均为转移性腺样囊性癌,因此相关结果不宜直接外推到原发肿瘤或其他亚型。检测方式为靶向测序,其可覆盖的基因组范围受所选 panel 限制,而这一限制的具体边界源站未提供。此外,数据集是否包含重复样本、配对正常对照或临床随访信息,源站未提供。

【引用与许可】

该研究对应的文献标识为 pmid:24418857,引用时可据此定位原始论文;由于该标识以 PubMed 编号形式给出,具体的 DOI 字符串源站未提供。数据集的许可条款、使用限制、再分发条件以及商业用途规定,源站未提供。建议使用者在使用前自行核对 cBioPortal 上该研究的页面说明与原始论文中的引用要求。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=acyc_fmi_2014

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

28例转移性腺样囊性癌样本的靶向测序。

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