乳腺癌脑转移影像基因组数据集

包含乳腺癌脑转移患者T1增强MRI及基因组相关信息,可用于转移性复发乳腺癌影像组学研究。由The Cancer Imaging Archive提供,来自TCIA,包含多种数据模态,包含165条数据记录,适用于分类任务,许可证为CC BY 4.0,专注于肿瘤领域的复发性乳腺癌研究。

The Cancer Imaging ArchiveThe Cancer Imaging Archive
TCIA
2025-01-28 更新
浏览 41
多模态分类Metastatic disease
BCBM-RadioGenomics

基本信息

模态
多模态
数据量
165
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-01-28
版本
Complete

资源简介

乳腺癌脑转移影像基因组数据集

【一句话概览】

该数据集为乳腺癌脑转移MRI数据,包含专家审核分割及肿瘤衍生影像组学特征,共165名受试者,文件合计10.7 GB。标签为转移性疾病,分类涵盖MR、分割、影像组学特征、人口学、分子检测及其他,采用CC BY 4.0许可。可用于机器学习、影像基因组学及神经外科、放射肿瘤和神经放射学教学等(来源 TCIA,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MRI Dataset of Metastatic Breast Cancer to the Brain with Expert-reviewed Segmentations and Tumor-derived Radiomic Features》。源站首次发布:2025/01/28。

【数据内容】

源站原始描述:This collection provides a platform for diverse applications ranging from the development of machine learning models in computer vision and radiogenomics to educational uses for neurosurgery, radiation oncology, and neuroradiology trainees. The comprehensiveness of this data makes it a prime resource for investigations on any individual component (raw images, genetics, radiomics, etc.)–whether serving as a validation dataset or as an exploratory one. Experts in computer vision may use the expert…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):该数据集为多种应用提供了平台,涵盖从计算机视觉和放射基因组学中机器学习模型的开发,到神经外科、放射肿瘤学和神经放射学受训者的教学用途。

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/rrse-w278。

【主题与分类】

源站学科分类:MR、Segmentation、Radiomic Feature、Demographic、Molecular Test、Other。主题标签:Metastatic disease。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/bcbm-radiogenomics/

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Taha, B., Wu, D., Sabal, L., Kollitz, M., Venteicher, A., & Watanabe, Y. (2025). MRI Dataset of Metastatic Breast Cancer to the Brain with Expert-reviewed Segmentations and Tumor-derived Radiomic Features (BCBM-RadioGenomics) (Version 1) [Dataset]. The Cancer Imaging Archive

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据说明

包含乳腺癌脑转移患者T1增强MRI及基因组相关信息,可用于转移性复发乳腺癌影像组学研究。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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