Yale脑转移纵向MRI数据集

包含脑转移患者纵向MRI影像及临床和图像元数据,可用于病灶检测、随访分析和疗效评估研究。由Yale School of Medicine提供,来自The Cancer Imaging Archive,包含11892条数据记录,适用于分类任务。

Yale School of MedicineYale School of Medicine
The Cancer Imaging Archive
2025-05-30 更新
浏览 55
图像分类Metastatic disease
Yale-Brain-Mets-Longitudinal

基本信息

模态
图像
数据量
11892
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2025-05-30
版本
Complete

资源简介

Yale脑转移纵向MRI数据集

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 43.00 GB、1430 例受试者,主题涵盖 Metastatic disease,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,CC BY 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Yale longitudinal dataset of brain metastases on MRI with associated clinical data》。源站首次发布:2025/05/30。

【数据内容】

源站原始描述:Radiology: Most of the MRI scans were obtained using 1.5T or 3T scanners manufactured by Siemens Healthineers or General Electric Healthcare. Image data and associated metadata were extracted through the application programming interface of Visage (Visage 7, Visage Imaging, Inc., San Diego, CA). DICOM metadata enabled the retrieval of key imaging parameters, including study location, scanner manufacturer, scanner model, magnetic field strength, acquisition type (2D vs. 3D), sequence designation,…

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):放射学:大多数 MRI 扫描均使用由 Siemens Healthineers 或 General Electric Healthcare 制造的 1.5T 或 3T 扫描仪获得。图像数据及相关元数据通过 Visage(Visage 7,Visage Imaging, Inc.,San Diego, CA)的应用程序编程接口提取。DICOM 元数据可用于检索关键成像参数,包括检查地点、扫描仪制造商、扫描仪型号、磁场强度、采集类型(2D vs. 3D)、序列名称、层厚、层间距、重复时间、回波时间和反转时间。每次扫描的这些采集参数的详细分解见随附 Excel 文件。

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/3yat-e768。

【主题与分类】

源站学科分类:MR、Demographic。主题标签:Metastatic disease。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/yale-brain-mets-longitudinal/

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Chadha, S., Weiss, D., Janas, A., Ramakrishnan, D., Hager, T., Osenberg, K., Willms, K., Zhu, J., Chiang, V., Bakas, S., Maleki, N., Sritharan, D. V., Schoenherr, S., Westerhoff, M., Zawalich, M., Davis, M., Malhotra, A., Bousabarah, K., Deusch, C., Lin, M., Aneja, S., & Aboian, M. S. (2025). Yale l…

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据说明

包含脑转移患者纵向MRI影像及临床和图像元数据,可用于病灶检测、随访分析和疗效评估研究。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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