SW837 USP22敲低细胞的mRNA-seq

资源简介

SW837 USP22敲低细胞的mRNA-seq

E-MTAB-8215 是一项针对人直肠癌细胞系 SW837 的 mRNA-seq 实验数据集，主题为 USP22 基因敲低后的转录组表达变化，属于差异表达类研究。该数据集由 EBI（ebi.ac.uk）收录，在分类上归入肿瘤／直肠癌方向。其核心价值在于提供 USP22 敲低条件下 SW837 细胞的基因表达谱信息，使研究者能够围绕差异表达分析考察该基因扰动对转录组的影响，并服务于肿瘤相关转录调控研究。整体而言，该数据集面向直肠癌分子机制探索，适合作为差异表达与基因功能研究的表达数据资源使用。

【数据集背景】

该数据集来源于 EBI 的 Expression Atlas 实验条目，属于 Differential（差异表达）类型的实验。物种为人（Homo sapiens），实验对象为 SW837 细胞系，处理方式为 USP22 基因敲低，检测手段为 mRNA-seq。USP22 敲低与直肠癌细胞转录组之间的联系是该数据集所承载的研究切入点，其设计目的即在于通过比较敲低与否条件下的表达谱，识别受 USP22 影响的基因表达变化。

【数据内容】

数据集提供 SW837 细胞在 USP22 敲低条件下的 mRNA-seq 转录组表达信息，覆盖直肠癌相关细胞系的基因表达层面数据。数据主题标签为 Differential，表明其组织方式围绕差异表达展开，可用于分析 USP22 基因敲低引起的基因表达变化。数据内容以转录组表达测量为主体，支持在基因水平上考察表达差异。

【采集与来源】

数据采集自 EBI（ebi.ac.uk）所收录的 Expression Atlas 实验，实验编号为 E-MTAB-8215，英文名称为“mRNA-seq of SW837 USP22 knockdown cells”。物种信息为 Homo sapiens，实验材料为 SW837 细胞系，实验类型为 mRNA-seq，实验性质为差异表达实验。源站描述同时给出了物种、实验类型与实验对象等基本信息。

【适用场景】

该数据集适用于直肠癌相关的转录组研究，尤其是围绕 USP22 基因敲低所引发的基因表达变化开展差异表达分析；也可用于肿瘤相关转录调控研究，考察基因扰动对细胞转录组的影响。由于数据以 SW837 细胞系为对象，其适用场景集中于细胞系水平的表达谱比较与差异基因识别。

【使用方法】

源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。