表达或缺失PD-L1的TRAMP-C2细胞代谢组分析

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aea0c07650e67fe3b53b164934e3a60cc331a8da2bc23d2b55c1c0aeeb7d510fb

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数据说明

免疫抑制性受体PD-1与其配体PD-L1之间的相互作用是改变免疫应答的关键机制，尤其是在癌症等慢性抗原暴露过程中。尽管大量研究聚焦于PD-1受体，但近期证据表明，PD-L1在癌症细胞和免疫细胞中可产生细胞内在效应。这些功能不同于其结合并触发PD-1活性的能力，且鉴于PD-L1在哺乳动物中广泛表达，这些功能尤为值得关注。其中一种细胞内在功能是调节细胞代谢，包括调控mTOR活性和糖酵解。作为我们研究PD-L1功能的一部分，我们分析了表达PD-L1或通过CRISPR/Cas9敲除PD-L1的培养小鼠前列腺癌细胞（TRAMP-C2）的代谢组。我们从表达或不表达PD-L1的TRAMP-C2细胞中定量了186种水溶性代谢物，以更好地理解PD-L1表达/活性调控了哪些代谢途径和过程。我们发现……，TRAMP-C2细胞在标准条件下培养。将细胞置于冰上并移除培养基。

细胞用冰冷的PBS洗涤两次，刮入预冷的2 mL管中，冷冻保存直至代谢物提取。样品与230 µL 1：1甲醇：水混合，并加入6颗洗涤过的1.4 mm陶瓷珠。样品涡旋10秒，加入220 µL乙腈后，以2000 rpm珠磨60秒进行细胞裂解（珠磨重复两次）。随后样品与2：1二氯甲烷：水溶液在冰上孵育10分钟。极性相和非极性相通过离心分离，条件为4000g、10分钟、1°C。上层极性相使用冷冻CentriVap真空浓缩器在-4°C下干燥。样品用水重悬。样品用水重悬后，在配备1290 Infinity II超高效液相色谱（Agilent Technologies）的Agilent 6470A串联四极杆质谱仪上运行，采用

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。