3Cl-HBA处理人PDAC原代CAF的链特异性RNA-seq
该数据集为DMSO或50 μM 3Cl-HBA处理24小时的人原代胰腺癌相关成纤维细胞（CAF）的链特异性RNA-seq数据，每组3个生物学重复
基本信息
资源简介
3Cl-HBA处理人PDAC原代CAF的链特异性RNA-seq
Strand-specific RNA-seq of human PDAC primary CAFs with 3Cl-HBA treatment
该数据集为DMSO或50 μM 3Cl-HBA处理24小时的人原代胰腺癌相关成纤维细胞（CAF）的链特异性RNA-seq数据，每组3个生物学重复。原始reads经fastp过滤后通过HISAT2比对到hg38，featureCounts定量基因表达，DESeq2分析差异表达基因。数据可用于研究3Cl-HBA对胰腺癌CAF转录组的影响，支持差异表达与通路分析（来源 DOI 解析，restricted access 许可）。
【数据集背景】
源站首次发布：2026。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：人原代CAF用DMSO或50 μM 3Cl-HBA处理24小时（每组3个生物学重复）。构建链特异性RNA-seq文库并在BGI DNBSEQ平台测序。原始reads经fastp过滤，通过HISAT2比对到hg38。基因表达由featureCounts定量。DEGs用DESeq2分析。
【主题与分类】
主题标签：Oncology、RNA sequencing、transcriptome、primary CAF of human pancreatic cancer、3Cl-HBA。本站分类：肿瘤/胰腺癌。
【获取与许可】
源站页面：https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=c821f235d36e4b029ee52f83e0654783
使用许可：restricted access。
下载信息
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源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.015kf
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人原代CAFs用DMSO或50 μM 3Cl-HBA处理24小时（每组3个生物学重复）。构建链特异性RNA-seq文库，并在BGI DNBSEQ平台上测序。原始reads经fastp过滤，通过HISAT2比对到hg38。基因表达用featureCounts定量。DEGs用DESeq2分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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