肿瘤信息ctDNA用于肌层浸润性膀胱癌残留/复发评估——TiMBER试验

该数据集来自clinicaltrials.gov的TiMBER试验,为一项观察性研究,面向肌层浸润性膀胱尿路上皮癌及Stage II、IIIA膀胱癌AJCC v8患者

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clinicaltrials
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基因组预测Stage II Bladder Cancer AJCC v8Stage IIIA Bladder Cancer AJCC v8
Tumor-informed ctDNA in Muscle-invasive Bladder Cancer for Evaluation of Residual/Recurrent Disease - the TiMBER Trial

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

肿瘤信息ctDNA用于肌层浸润性膀胱癌残留/复发评估——TiMBER试验

TiMBER试验数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦于肌层浸润性膀胱癌中肿瘤信息循环肿瘤DNA(ctDNA)的应用,旨在评估残留或复发疾病的检测价值。该数据集面向肌层浸润性膀胱尿路上皮癌以及Stage II、Stage IIIA膀胱癌AJCC v8患者,属于肿瘤领域的观察性研究数据。其核心目标在于探索癌症复发与ctDNA阳性之间的对应关系,通过前瞻性收集血液、组织和尿液样本,结合全基因组测序分析肿瘤DNA水平,并回顾医疗记录以判断ctDNA水平是否与治疗反应或疾病复发相关。该数据集为理解ctDNA在膀胱癌术后监测中的潜在作用提供了结构化的临床与分子数据基础。

【数据集背景】

肌层浸润性膀胱尿路上皮癌是一种具有较高复发和进展风险的恶性肿瘤,准确评估治疗后残留病灶及早期识别复发是临床管理中的关键挑战。传统的影像学和组织病理学检查在灵敏度和时效性上存在局限,而循环肿瘤DNA作为一种微创液体活检标志物,近年来在肿瘤监测领域受到广泛关注。TiMBER试验正是在这一背景下设计,针对Stage II和Stage IIIA膀胱癌AJCC v8患者群体,探索肿瘤信息ctDNA能否作为评估残留或复发疾病的可靠指标。该试验为观察性研究,不涉及干预性治疗分配,而是通过系统性的样本采集和纵向随访,建立ctDNA检测结果与临床结局之间的关联证据。

【数据内容】

该数据集涵盖的受试人群为肌层浸润性膀胱尿路上皮癌患者,具体包括Stage II膀胱癌AJCC v8和Stage IIIA膀胱癌AJCC v8。研究采集的样本类型包括血液、组织和尿液,用于基于全基因组测序评估肿瘤DNA水平。主要目标为评估癌症复发与ctDNA阳性之间的对应关系。此外,研究还会审查患者的医疗记录,以分析ctDNA水平与疾病对治疗的反应或复发之间是否存在相关性。数据集的主题标签同样指向上述三种疾病分类,反映了其聚焦的疾病范围。关于样本量、随访时长、具体测序深度或ctDNA检测阈值等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自clinicaltrials.gov,对应TiMBER试验。研究设计为观察性研究,患者接受前瞻性样本采集,包括血液、组织和尿液,以基于其癌症的全基因组测序评估肿瘤DNA水平。医疗记录将在研究过程中被审查,以观察ctDNA水平是否与疾病对治疗的反应或复发相关。数据来源为临床试验注册平台,属于肿瘤领域的观察性研究数据。关于采集时间点、采集频率、样本处理流程或测序平台的具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肌层浸润性膀胱尿路上皮癌及Stage II、Stage IIIA膀胱癌AJCC v8相关的临床研究场景,尤其是探索ctDNA作为残留或复发疾病生物标志物的研究。潜在应用包括:分析ctDNA阳性与癌症复发之间的对应关系;评估ctDNA水平与治疗反应或疾病复发的相关性;为液体活检在膀胱癌监测中的价值提供观察性证据。此外,该数据集也可用于方法学参考,例如设计类似的前瞻性样本采集与医疗记录回顾相结合的研究。关于具体的统计分析计划或预设的临床效用终点,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为观察性研究数据,使用者可基于血液、组织和尿液样本的全基因组测序结果,结合医疗记录中关于治疗反应和复发的信息,开展ctDNA与临床结局的关联分析。主要分析方向为评估癌症复发与ctDNA阳性之间的对应关系。由于研究设计为前瞻性样本采集与医疗记录审查,使用者需注意数据的纵向性质,并考虑如何将ctDNA检测结果与复发时间点进行匹配。关于数据访问方式、是否需要申请、是否提供原始测序数据或仅提供衍生指标,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自clinicaltrials.gov注册的观察性研究,其质量取决于试验执行过程中的样本采集、测序和医疗记录审查的标准化程度。作为观察性研究,该数据集无法确立ctDNA与复发之间的因果关系,仅能评估对应关系或相关性。此外,研究聚焦于Stage II和Stage IIIA肌层浸润性膀胱尿路上皮癌患者,结论外推至其他分期或组织学类型时需谨慎。关于样本量、缺失数据比例、随访完整性或测序质量控制指标,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为clinicaltrials.gov,对应TiMBER试验。关于具体的引用格式、数据使用许可、访问限制或知识产权归属,源站未提供。使用者应直接参考clinicaltrials.gov上该试验的注册信息以获取最新和完整的引用与许可要求。

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源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT07726602

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:肌层浸润性膀胱尿路上皮癌,AJCC第8版II期膀胱癌,AJCC第8版IIIA期膀胱癌。主要目标:I. 评估癌症复发与ctDNA阳性的对应关系。概述:这是一项观察性研究。患者将前瞻性地收集血液、组织和尿液样本,基于其癌症的全基因组测序来评估肿瘤DNA水平。研究期间将审查其医疗记录,以观察ctDNA水平是否与治疗反应或疾病复发相关。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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