面向生物标志物引导放疗：多组学分析揭示ATM状态与肺腺癌放射抵抗的关联

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23736151

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 453.5 MB。

数据说明

该Zenodo记录包含支撑研究《迈向生物标志物指导的放射治疗：多组学分析将ATM状态与肺腺癌放射抵抗性相关联》（Riedl等，2025）的经处理功能测定数据和分析输出。数据集包括在ATM功能正常和ATM缺陷的肺腺癌（LUAD）细胞系中，暴露于照射和/或ATM抑制剂AZD1390后进行的克隆形成存活测定（CFA）、MTS活力测定和xCELLigence实时阻抗测量的定量结果。每个数据包均包含原始和处理后的表格、图表以及描述实验条件和重复的相应元数据。所有分析均使用R进行，完整代码可通过GitHub获取，网址为https://github.com/annaluisariedl-91/Riedl_2025_LUAD_ATM_Radiation。

随附的转录组（RNA-seq）和蛋白质组数据集分别存放于公共数据库：转录组数据（RNA-seq）：Biostudies，登录号 https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-MTAB-16218；蛋白质组数据（LC–MS/MS）：PRIDE，登录号 PXD071187。这些数据集共同构成了一个整合的多组学资源，可用于研究ATM状态对LUAD细胞系辐射应答和DNA损伤信号传导的影响。关键词：LUAD，ATM，辐射，AZD1390，克隆形成实验，MTS，xCELLigence，RNA-seq，蛋白质组学，多组学

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。