微小病变肾病：蛋白质组学方法
该数据集来自 omicsdi.org，围绕微小病变肾病（MCD）的肾小球蛋白质组学研究，采用无标记定量质谱的鸟枪法蛋白质组学，对两组样本（对照组 CTR 与 MCD 组）的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肾活检组织进行分析
基本信息
资源简介
微小病变肾病：蛋白质组学方法
该数据集围绕微小病变肾病（MCD）的肾小球蛋白质组学研究展开，采用无标记定量质谱的鸟枪法蛋白质组学策略，对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）肾活检组织中的肾小球进行蛋白质组分析。研究设置对照组（CTR）与MCD组两类样本，旨在通过肾小球蛋白质组的比较分析，为理解MCD的潜在病理生理机制提供线索。数据集来源于omicsdi.org，主题标签为Proteomics，在本站归入泌尿生殖系统疾病下的其他类别。整体而言，该数据集属于蛋白质组学范畴的疾病研究数据，其核心价值在于将激光显微切割、FFPE样本处理与无标记定量质谱相结合，形成针对肾小球这一特定结构的蛋白质组学分析流程与结果数据。
【数据集背景】
微小病变肾病（MCD）是一种需要深入阐明其病理生理机制的肾脏疾病。该研究以肾小球为分析对象，借助蛋白质组学手段探索MCD的潜在病理生理学基础。研究采用鸟枪法蛋白质组学（shotgun proteomics）结合无标记定量质谱（label-free quantitative mass spectrometry），对FFPE肾活检样本进行蛋白质层面的定量比较，试图从肾小球蛋白质组成与丰度变化的角度获得与MCD相关的线索。数据集即在这一研究背景下产生，主题归属于蛋白质组学。
【数据内容】
数据集对应的研究包含两组样本：对照组（CTR）与微小病变肾病组（MCD）。分析对象为从FFPE肾活检组织中获取的肾小球。数据内容涉及基于无标记定量质谱的鸟枪法蛋白质组学分析结果，其技术路线包括激光显微切割（LCM）获取肾小球，以及采用单管固相增强样品制备（SP3）消化方法以提高产量和蛋白质鉴定数量。源站未提供具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、定量结果列表或差异蛋白清单等细节。
【采集与来源】
样本来源为福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）的肾活检组织。肾小球通过激光捕获显微切割（laser capture microdissection, LCM）从FFPE肾活检组织中切取。样本制备采用单管固相增强样品制备（single-pot solid-phase-enhanced sample preparation, SP3）消化方法，以改善产量与蛋白质鉴定效果。数据采集依托无标记定量质谱的鸟枪法蛋白质组学流程。数据集来源站为omicsdi.org。源站未提供具体的采集机构、采集时间与地理来源等信息。
【适用场景】
该数据集适用于与微小病变肾病肾小球蛋白质组相关的分析场景，例如基于质谱的肾小球蛋白质组数据查阅、FFPE肾活检样本的蛋白质组学流程参考，以及对照（CTR）与MCD组之间蛋白质组比较研究的复用与二次分析。其技术组合（LCM获取肾小球、SP3消化、无标记定量鸟枪法蛋白质组学）也可作为方法学层面的参考。源站未提供关于临床诊断、疗效评估或生物标志物验证等具体应用场景的说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕对照组与MCD组的肾小球蛋白质组定量结果开展比较分析。由于数据来自FFPE肾活检组织并经LCM与SP3处理，分析中需考虑该样本类型与制备流程对蛋白质鉴定与定量的影响。源站未提供数据文件格式、下载方式、分析软件参数或具体分析步骤等信息。
【质量与限制】
该研究采用SP3消化方法以改善产量和蛋白质鉴定数量，说明样本制备环节针对FFPE组织的蛋白质组分析进行了优化。源站未提供样本量、鉴定深度、定量重复性、缺失值比例等质量指标，也未提供数据的具体限制说明。使用者在解释结果时需注意源站未提供相关验证信息。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000094293
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在通过肾小球蛋白质组学分析，揭示微小病变肾病（MCD）的潜在病理生理机制。采用无标记定量质谱的鸟枪法蛋白质组学技术，对两组样本的福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）肾活检组织进行分析：对照组（CTR）和MCD组。使用激光捕获显微切割（LCM）从FFPE肾活检组织中切取肾小球，并采用单管固相增强样品制备（SP3）消化法以提高产量和蛋白质鉴定数量。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
