硒对炎症的代谢调控
该数据集来自 omicsdi.org,围绕微量元素硒(Se)经 tRNA[Ser]Sec 掺入硒蛋白后对炎症及消退过程的代谢调控展开

基本信息
资源简介
硒对炎症的代谢调控
该数据集来自 omicsdi.org,围绕微量元素硒(Se)经 tRNA[Ser]Sec 掺入硒蛋白后对炎症及消退过程的代谢调控展开。研究以小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)为对象,在有或无亚硒酸盐条件下经 LPS 激活,采用多重串联质量标签定量蛋白质组学、代谢组学与机器学习方法分析蛋白质组和代谢组的时序变化,揭示硒依赖的糖酵解、TCA 与 PPP 通路调控使 BMDMs 优先增强 OXPHOS 以调节炎症及其及时消退。数据可用于炎症代谢重编程与硒生物学研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):微量元素硒(Se)通过 tRNA[Ser]Sec 作为第 21 种氨基酸硒代半胱氨酸(Sec)掺入硒蛋白。硒蛋白是氧化还原稳态的守门人,并调节免疫功能以实现抗炎和炎症消退。然而,涉及炎症及消退期间代谢重编程的机制基础仍知之甚少。在内毒素脂多糖(LPS)激活小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)时,在存在或不存在硒(作为亚硒酸盐)的条件下培养,采用多重串联质量标签定量蛋白质组学、代谢组学和机器学习方法检查蛋白质组和代谢组的时序变化。硒依赖的糖酵解、TCA 和 PPP 通路调控使 BMDMs 倾向于优先增加 OXPHOS,以有效调节炎症及其及时消退。使用 macr
【主题与分类】
主题标签:Proteomics、Macrophages、Succinate dehydrogenase、Selenium。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD023005
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD023005
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
微量元素硒(Se)通过tRNA[Ser]Sec以第21种氨基酸——硒代半胱氨酸(Sec)的形式掺入硒蛋白中。硒蛋白作为氧化还原稳态的守门人,并调节免疫功能以实现抗炎和炎症消退。然而,涉及炎症及消退过程中代谢重编程的机制基础仍知之甚少。本研究采用内毒素脂多糖(LPS)激活小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs),在存在或不存在硒(以亚硒酸盐形式)的条件下培养,通过多重串联质量标签定量蛋白质组学、代谢组学和机器学习方法,检测蛋白质组和代谢组的时间变化。硒依赖性的糖酵解、TCA循环和PPP途径调控使BMDMs优先增加OXPHOS,从而有效调节炎症及其及时消退。使用缺乏硒蛋白的巨噬细胞表明,所有三个代谢节点均对硒蛋白组表达敏感。此外,在小鼠腹膜炎模型中,用二甲基丙二酸抑制SDH可通过延长消退间期影响硒的促消退作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




