常见TMEM173 HAQ、AQ等位基因挽救CD4 T细胞减少、恢复调节性T细胞并预防小鼠SAVI(N153S)炎症性疾病
该数据集来自search.dataone.org,聚焦STING(由TMEM173基因编码)在组织炎症与肿瘤免疫治疗中的作用

基本信息
资源简介
常见TMEM173 HAQ、AQ等位基因挽救CD4 T细胞减少、恢复调节性T细胞并预防小鼠SAVI(N153S)炎症性疾病
The common TMEM173 HAQ, AQ alleles rescue CD4 T cellpenia, restore T-regs, and prevent SAVI (N153S) inflammatory disease in mice
该数据集来自search.dataone.org,聚焦STING(由TMEM173基因编码)在组织炎症与肿瘤免疫治疗中的作用。研究涉及常见人类STING等位基因HAQ(R71H-G230A-R293Q)和AQ(G230A-R293Q),以及STING敲入小鼠中表达的HAQ、AQ和Q293等位基因。数据可用于探究这些等位基因对SAVI(婴儿期起病的STING相关血管病)相关CD4 T细胞减少及炎症表型的调节作用,并支持STING残基293在细胞死亡中关键作用的分析(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):STING(由TMEM173基因编码)在组织炎症和肿瘤免疫治疗中的重要性已被日益认识。有趣的是,常见人类STING等位基因R71H-G230A-R293Q(HAQ)和G230A-R293Q(AQ)分别由约60%的东亚人和约40%的非洲人携带。在此,我们研究HAQ、AQ等位基因对SAVI(婴儿期起病的STING相关血管病)的调节作用,SAVI是一种由人类STING功能获得性突变引起的常染色体显性、致死性炎症性疾病。SAVI患者和小鼠模型中存在明显的CD4 T细胞减少。使用表达常见人类STING等位基因HAQ、AQ和Q293的STING敲入小鼠,我们发现HAQ、AQ和Q293脾细胞在离体条件下抵抗STING介导的细胞死亡,确立了STING残基293在细胞死亡中的关键作用。HAQ/SAVI(N153S)和AQ/SAVI(N153S)小鼠没有CD4 T细胞减少。
【主题与分类】
主题标签:SAVI、Sting、Human STING Alleles、T cellpenia。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A4de1bbeea63aac4fdaacb3f758f1c8116ca735b88f6279ff074c2c1d4d39d419
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
数据说明
STING(由TMEM173基因编码)在组织炎症和癌症免疫治疗中的重要性日益受到认识。有趣的是,常见的人类STING等位基因R71H-G230A-R293Q(HAQ)和G230A-R293Q(AQ)分别由约60%的东亚人和约40%的非洲人携带。在此,我们研究了HAQ、AQ等位基因对STING相关婴儿期发病血管病变(SAVI)的调节作用,SAVI是一种由人类STING功能获得性突变引起的常染色体显性、致死性炎症性疾病。在SAVI患者和小鼠模型中,CD4 T细胞减少明显。使用表达常见人类STING等位基因HAQ、AQ和Q293的STING敲入小鼠,我们发现HAQ、AQ和Q293脾细胞在离体条件下抵抗STING介导的细胞死亡,确立了STING第293位残基在细胞死亡中的关键作用。HAQ/SAVI(N153S)和AQ/SAVI(N153S)小鼠未出现CD4 T细胞减少。
HAQ/SAVI(N153S)、AQ/SAVI(N153S)小鼠的T-regs分别比WT/SAVI(N153S)小鼠多约10倍、约20倍……请参见手稿的“方法”部分。
数据来源:常见的TMEM173 HAQ、AQ等位基因可挽救CD4 T细胞减少、恢复T-regs并预防小鼠SAVI(N153S)炎症性疾病 https://doi.org/10.5061/dryad.m0cfxppcv
数据及文件结构说明
图1. 来自HAQ、AQ和Q293小鼠的脾细胞在体外对STING介导的细胞死亡具有抗性。(A). C57BL/6N脾细胞在培养中直接(未转染)用diABZI(100ng/ml)、RpRpss-环二AMP(5 μg/ml)或2′3′-cGAMP(10μg/ml)、DMXAA(25μg/ml)处理24小时。通过PI染色测定CD4、CD8 T细胞和CD19 B细胞的死亡。(B). 来自C57BL/6N小鼠的脾细胞用指定的小分子GSK2334470(1.25µM)、GSK8612(2.5µM)、Bx-795(0.5µM)、QVD-OPH(25µM)预处理2小时。在培养中加入diABZI(100ng/ml)再处理24小时。通过PI染色测定死亡细胞。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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