ROCK1通过促进ATR介导的DNA损伤修复抑制前列腺癌STING通路激活

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0f03b6220bf38148dbf4dea84b51fa85d9c7d01ce7e12c3059d2dff64ec838cc

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

干扰素基因刺激因子（STING）通路是抗肿瘤免疫的核心调控因子，但其在前列腺癌中的激活仍然有限。本研究通过聚焦激酶组的CRISPR筛选和基于p-STING的流式分选，鉴定出ROCK1是前列腺癌细胞中STING信号的抑制因子。体外和体内实验表明，敲低ROCK1或使用ROCK抑制剂处理可显著上调p-STING及下游STING通路基因。磷酸蛋白质组学分析显示，敲低ROCK1后ATR及其他核心DNA损伤修复蛋白的磷酸化水平降低，同时DNA损伤标志物表达升高。机制上，共免疫沉淀和免疫荧光实验证明，敲低ROCK1可显著减弱ATR/ATRIP与RPA32之间的结合及其在细胞核内的共定位。

救援实验进一步表明，全长ROCK1或其N端结构域的重表达可恢复ATRIP-RPA32结合及ATR磷酸化…, , # ROCK1通过促进ATR介导的DNA损伤修复在前列腺癌中抑制STING通路激活 数据集DOI：10.5061/dryad.0k6djhbh0 ## 数据和文件结构描述 该数据集包含两个标准格式的单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵，分别来自经ROCK1敲低和对照处理的RM-1细胞来源的小鼠皮下肿瘤。该数据集还包含比较ROCK1敲低PC3细胞与对照PC3细胞的磷酸化蛋白质组学矩阵数据。 ### 文件和变量 #### 文件：phospho-MS.csv 描述： 来自经ROCK1敲低或阴性对照（NC）处理的PC3细胞的磷酸化蛋白质组质谱数据矩阵（每组n = 2）。 ##### 变量 * Gene：蛋白质ID * NC-1_intensity：NC组第一个样本中蛋白质分子的磷酸化强度。 * NC-2_intensity：NC组第二个样本中蛋白质分子的磷酸化强度。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。