分子动力学潜空间残基对网络区分配体激活与SAVI相关STING的数据与代码
主题标签:免疫系统疾病、原发性免疫缺陷、STING、SAVI、分子动力学、潜空间残基对网络、数据与代码。本站分类:免疫系统疾病/原发性免疫缺陷

基本信息
资源简介
分子动力学潜空间残基对网络区分配体激活与SAVI相关STING的数据与代码
该数据集为一项围绕STING蛋白相关分子机制的研究所配套发布的数据与代码档案,英文名称为“Data and code for 'Latent-Space Residue-Pair Networks from Molecular Dynamics Distinguish Ligand-Activated and SAVI-Associated STING'”。数据集由Tsuchiya, Yuko与Yonezawa, Yasushige共同完成,托管于Zenodo,发布时间为2026年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。其主题涉及免疫系统疾病与原发性免疫缺陷,核心方法为分子动力学模拟与潜空间残基对网络分析,旨在区分配体激活状态与SAVI相关突变状态下的STING蛋白。档案中包含数据与代码两部分,具体文件说明由README.md提供。
【数据集背景】
STING是固有免疫信号通路中的关键蛋白,其异常激活与一类称为SAVI的原发性免疫缺陷疾病相关。该数据集所对应的研究,尝试从分子动力学模拟轨迹中构建潜空间残基对网络,以区分配体激活的STING与SAVI相关突变体STING。数据集被归类于免疫系统疾病与原发性免疫缺陷方向,服务于对STING功能状态判别的研究需求。
【数据内容】
该档案包含与论文“Latent-Space Residue-Pair Networks from Molecular Dynamics Distinguish Ligand-Activated and SAVI-Associated STING”相关的数据与代码。源站描述指出,档案内各文件的说明在README.md中提供。除上述说明外,源站未提供关于文件数量、格式、大小或具体数据类型的进一步信息。
【采集与来源】
数据集来源站为doi.org,托管机构为Zenodo。作者为Tsuchiya, Yuko与Yonezawa, Yasushige。发布时间为2026年。关于分子动力学模拟的具体采集条件、软件参数、模拟时长或样本来源,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与STING蛋白构象状态判别相关的研究场景,尤其是利用分子动力学轨迹与潜空间残基对网络方法区分配体激活态与SAVI相关突变态的分析工作。其主题标签包括免疫系统疾病、原发性免疫缺陷、STING、SAVI、分子动力学、潜空间残基对网络、数据与代码。除此之外的具体应用场景,源站未提供。
【使用方法】
源站描述仅说明档案包含数据与代码,且文件描述在README.md中提供。关于如何运行代码、依赖环境、输入输出格式或复现步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名条件下使用。关于数据质量评估、模拟验证、潜在偏差或技术限制,源站未提供。
【引用与许可】
使用该数据集时应遵循Creative Commons Attribution 4.0 International许可要求,进行适当署名。作者为Tsuchiya, Yuko与Yonezawa, Yasushige,托管于Zenodo,发布年份为2026年。具体的引用格式或推荐引用文献,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.23232081
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 5.25 GB。
数据说明
该存档包含与手稿《来自分子动力学的潜在空间残基对网络区分配体激活型与SAVI相关型STING》相关的数据与代码。文件说明见README.md。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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