SWATH-MS鉴定CXCL7、LBP、TGFβ1和PDGFRβ作为人类系统性肥大细胞增多症的新生物标志物
主题标签：系统性肥大细胞增多症、SWATH-MS、生物标志物、蛋白质组学、肿瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖系统性肥大细胞增多症。
基本信息
资源简介
SWATH-MS鉴定CXCL7、LBP、TGFβ1和PDGFRβ作为人类系统性肥大细胞增多症的新生物标志物
该数据集英文名称为“SWATH-MS identification of CXCL7, LBP, TGFβ1 and PDGFRβ as novel biomarkers in human systemic mastocytosis”，来自 ebI.ac.uk，在站内归入肿瘤 / 其他分类。其主题围绕系统性肥大细胞增多症展开，采用 SWATH-MS 技术开展蛋白质组学研究，旨在识别 CXCL7、LBP、TGFβ1 与 PDGFRβ 等候选生物标志物，属于肿瘤领域的公开数据集。数据集以蛋白质组学检测为核心，关联生物标志物发现这一典型应用方向，可供关注系统性肥大细胞增多症及相关肿瘤研究的人员检索与使用。以下依据可获得的信息，从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面作进一步说明。
【数据集背景】
系统性肥大细胞增多症是一种与肥大细胞异常增殖相关的疾病，在肿瘤研究分类中具有其特定位置。该数据集以“SWATH-MS identification of CXCL7, LBP, TGFβ1 and PDGFRβ as novel biomarkers in human systemic mastocytosis”为题，说明其工作聚焦于在人类系统性肥大细胞增多症样本中，通过 SWATH-MS 技术识别 CXCL7、LBP、TGFβ1 和 PDGFRβ 作为新的生物标志物。数据集的主题标签包括系统性肥大细胞增多症、SWATH-MS、生物标志物、蛋白质组学与肿瘤，反映出其研究背景位于蛋白质组学与肿瘤生物标志物发现的交叉领域。源站描述中给出了该数据集的题名与访问地址，指向蛋白质组学数据存档中的相应项目页面。
【数据内容】
该数据集属于蛋白质组学数据，核心内容是围绕系统性肥大细胞增多症开展的 SWATH-MS 鉴定工作，涉及 CXCL7、LBP、TGFβ1 与 PDGFRβ 这四种被提出作为新型生物标志物的蛋白质。数据集的主题涵盖系统性肥大细胞增多症，并带有 SWATH-MS、生物标志物、蛋白质组学与肿瘤等标签。除上述主题与标志物名称外，源站未提供关于样本数量、文件格式、谱图数量、鉴定蛋白总数或定量结果表等更细粒度的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebI.ac.uk，源站描述中给出的访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030947，指向 PRIDE 存档中的项目页面。源站描述同时标注了“bobby graham”这一与数据集相关的名称信息。除来源站点、项目地址以及题名所体现的 SWATH-MS 技术路线外，源站未提供关于样本采集地点、仪器型号、实验设计细节或数据处理流程的具体说明。
【适用场景】
基于其主题与分类，该数据集适用于肿瘤领域中与系统性肥大细胞增多症相关的研究场景，尤其是围绕 SWATH-MS 蛋白质组学数据开展生物标志物发现、候选标志物验证思路讨论以及蛋白质组学方法学参考等工作。由于数据集明确涉及 CXCL7、LBP、TGFβ1 与 PDGFRβ 作为新型生物标志物的鉴定，也可用于与这四种蛋白质相关的文献对照和结果复现性讨论。需要说明的是，具体适用场景的边界应以源站项目页面提供的信息为准，源站未提供更详细的适用条件说明。
【使用方法】
该数据集可通过源站描述中给出的 PRIDE 项目地址进行访问，即 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030947。使用者可依据该页面获取数据集相关信息。除访问地址外，源站未提供关于下载方式、文件组织、分析软件参数或复现步骤的具体说明。
【质量与限制】
该数据集来自 ebI.ac.uk 的 PRIDE 存档，具备公开可访问的项目地址。就目前可获得的信息而言，源站未提供关于数据质量评估、缺失值处理、定量准确性或批次效应等方面的说明。因此，使用者在引用或再利用该数据集时，应结合源站项目页面的原始信息自行判断其适用范围与局限。源站未提供其他质量与限制方面的具体内容。
【引用与许可】
源站描述中给出的引用信息为：“bobby graham, SWATH-MS identification of CXCL7, LBP, TGFβ1 and PDGFRβ as novel biomarkers in human systemic mastocytosis. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030947”。关于该数据集的许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030947
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
bobby graham, SWATH-MS identification of CXCL7, LBP, TGFβ1 and PDGFRβ as novel biomarkers in human systemic mastocytosis. [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD030947
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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