研究年轻及青少年软组织肉瘤患者组织样本中的基因

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT01567046

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病类型：儿童肺泡状软组织肉瘤、儿童血管肉瘤、儿童促结缔组织增生性小圆细胞肿瘤、儿童上皮样肉瘤、儿童纤维肉瘤、儿童平滑肌肉瘤、儿童脂肪肉瘤、儿童恶性间叶瘤。研究亚型：辅助/相关性观察性研究 模型：队列 时间视角：回顾性 生物样本保留：含DNA样本 生物样本描述：组织 研究人群描述：来自COG D9902/ARST0332研究的现有NRSTS样本 抽样方法：非概率抽样 目的：I. 通过质谱（MS）分析肿瘤来源的脱氧核糖核酸（DNA），确定在存档的非横纹肌肉瘤软组织肉瘤（NRSTS）肿瘤标本中发现可操作突变的频率。概述：通过聚合酶链反应（PCR）和质谱（Sequenom MassARRAY）分析存档的DNA组织样本，以确定基因突变的频率，包括单核苷酸多态性（SNPs）、单核苷酸变异（SNVs）以及小片段缺失和/或插入。

随后对结果进行分析，以确定特定突变是否与患者或疾病特征（如肿瘤分期、组织学分级或预后）相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。