基本信息

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创建/更新时间

2026-10-07

资源简介

PDC：口腔鳞状细胞癌 - 长庚大学

PDC: Oral Squamous Cell Carcinoma - Chang Gung University 是一个面向肿瘤研究领域的公开蛋白质组学数据集，归属于国际癌症蛋白质基因组联盟（International Cancer Proteogenome Consortium）框架下的癌症蛋白质组学数据资源。该数据集聚焦口腔鳞状细胞癌这一特定肿瘤类型，由长庚大学相关研究项目产生，并通过蛋白质组数据共享平台 Proteomic Data Commons（PDC）对外发布。作为癌症蛋白质组学与蛋白质基因组学研究的组成部分，该数据集为探索口腔鳞状细胞癌在蛋白质层面的分子特征提供了数据基础，适用于肿瘤生物学、临床转化研究以及多组学整合分析等方向。整体而言，该数据集属于肿瘤/其他分类下的公开资源，主题标签涵盖口腔鳞状细胞癌、肿瘤、蛋白质组学、癌症蛋白质组学、PDC 与 CPTAC 等关键词。

【数据集背景】

该数据集来源于国际癌症蛋白质基因组联盟（International Cancer Proteogenome Consortium）框架下的研究项目，项目名称为 Oral Squamous Cell Carcinoma - Chang Gung University。国际癌症蛋白质基因组联盟致力于推动癌症蛋白质基因组学研究的国际合作与数据共享，通过整合蛋白质组学与基因组学等多层次数据，加深对癌症发生发展机制的理解。口腔鳞状细胞癌是头颈部肿瘤中常见的病理类型之一，针对该肿瘤开展蛋白质组学层面的系统研究，有助于揭示其蛋白质表达特征与潜在分子机制。该数据集正是在这一背景下，由长庚大学相关项目产生并纳入 PDC 平台进行公开共享，属于癌症蛋白质组学（PDC/CPTAC）数据体系的一部分。

【数据内容】

该数据集属于癌症蛋白质组学数据集，其核心内容围绕口腔鳞状细胞癌的蛋白质组学数据展开。根据源站描述，该数据集被标注为癌症蛋白质组学数据（PDC/CPTAC），并归属于国际癌症蛋白质基因组联盟项目。数据集的主题标签包括口腔鳞状细胞癌、肿瘤、蛋白质组学、癌症蛋白质组学、PDC 以及 CPTAC，反映出其在肿瘤蛋白质组学研究中的定位。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、定量指标、临床注释字段等详细内容，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 proteomic.datacommons.cancer.gov，即蛋白质组数据共享平台（Proteomic Data Commons，PDC）。源站描述表明，该数据集为 PDC 项目 Oral Squamous Cell Carcinoma - Chang Gung University，所属项目为 International Cancer Proteogenome Consortium，数据类型为癌症蛋白质组学数据集（PDC/CPTAC）。数据集由长庚大学相关研究项目产生。关于样本采集的具体流程、实验方法、仪器平台、样本处理与质控步骤等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤学与蛋白质组学相关的研究场景。作为口腔鳞状细胞癌的癌症蛋白质组学数据资源，其潜在应用方向包括：口腔鳞状细胞癌的蛋白质表达特征分析、肿瘤分子机制探索、蛋白质组学与基因组学等多组学数据的整合研究，以及国际癌症蛋白质基因组联盟框架下的跨数据集比较与协作研究。此外，该数据集也可用于癌症蛋白质组学方法学的验证与参考。关于具体的适用分析流程或推荐工具，源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过蛋白质组数据共享平台（PDC）发布，用户可访问来源站 proteomic.datacommons.cancer.gov 获取该数据集。关于数据的具体下载方式、文件格式、访问权限设置、是否需要注册或申请、以及配套的分析工具与接口等信息，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于国际癌症蛋白质基因组联盟项目，并通过 PDC 平台进行共享，属于公开的癌症蛋白质组学数据资源。关于数据的质量控制指标、样本量大小、覆盖度、批次效应、缺失值情况以及其他可能影响分析结果的技术限制，源站未提供。使用者在开展研究时，应结合源站提供的原始说明与元数据自行评估数据的适用性。

【引用与许可】

该数据集归属于 PDC 项目 Oral Squamous Cell Carcinoma - Chang Gung University，来源站为 proteomic.datacommons.cancer.gov。关于该数据集的具体引用格式、许可协议、使用条款以及数据再分发规定等信息，源站未提供。使用者在使用该数据集时，应遵循来源站发布的相关政策与要求。

原始链接

https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/d78374f9-5fd5-4776-aa41-b1fe7ef338ab

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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数据集获取

源站：https://proteomic.datacommons.cancer.gov/pdc/study/d78374f9-5fd5-4776-aa41-b1fe7ef338ab

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PDC project Oral Squamous Cell Carcinoma - Chang Gung University. Program: International Cancer Proteogenome Consortium. Cancer proteomics dataset (PDC/CPTAC).

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别