人类皮层2-3层微环路中的有向无环突触连接

该数据集来自人类颞叶皮层脑手术样本,包含第2-3层锥体神经元的多神经元膜片钳记录,用于研究人类皮层微环路的突触连接特性。数据覆盖突触互惠性、连接概率、突触强度及网络拓扑等指标,并与啮齿类动物进行比较

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文本分类Recurrent neural networkslayer 2-3patch-clampconnectivitycortexEpilepsyNetwork motifspyramidal neuronmulti-patchtemporalDirected acyclic graphshuman
Directed and acyclic synaptic connectivity in the human layer 2-3 cortical microcircuit

基本信息

模态
文本
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创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

人类皮层2-3层微环路中的有向无环突触连接

Directed and acyclic synaptic connectivity in the human layer 2-3 cortical microcircuit

该数据集来自人类颞叶皮层脑手术样本,包含第2-3层锥体神经元的多神经元膜片钳记录,用于研究人类皮层微环路的突触连接特性。数据覆盖突触互惠性、连接概率、突触强度及网络拓扑等指标,并与啮齿类动物进行比较。分析显示人类颞叶皮层上颗粒层连接呈有向且大多无环的图拓扑,互惠性随机分布,突触强度与连接概率无关。该数据可用于神经元网络建模、递归神经网络与储备池计算研究,以及探索皮层计算特性(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):神经元网络的计算能力从根本上受其特定连接方式的约束。以往关于皮层连接的研究大多在啮齿类动物中进行;然而,这些原则是否同样适用于进化上扩张的人类皮层尚不清楚。在此,我们利用脑外科手术获得的样本研究了人类颞叶皮层内的网络特性。我们分析了第2-3层锥体神经元的多神经元膜片钳记录,并发现了与啮齿类动物的实质性差异。互惠性呈随机分布,突触强度独立于连接概率,且上颗粒层颞叶皮层的连接遵循有向且大多无环的图拓扑。将这些原则应用于神经元模型增加了网络动力学的维度,表明皮层计算具有关键作用

【主题与分类】

主题标签:Recurrent neural networks、layer 2-3、patch-clamp、connectivity、cortex、Epilepsy、Network motifs、pyramidal neuron、multi-patch、temporal。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Ae5e0a8447f7deebbe9677eac7c7f6734c646ca88d6adea5155ddd9cce42bb8f3

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

神经元网络的计算能力从根本上受其特定连接方式的限制。以往关于皮层连接性的研究大多在啮齿动物中进行;然而,这些原则是否同样适用于进化上扩展的人类皮层尚不清楚。在此,我们利用脑外科手术获取的样本研究了人类颞叶皮层内的网络特性。我们分析了第2-3层锥体神经元的多神经元膜片钳记录,并发现了与啮齿动物的显著差异。互惠性呈随机分布,突触强度与连接概率无关,且颞叶皮层颗粒上层的连接性遵循有向且大多无环的图拓扑结构。将这些原则应用于神经元模型增加了网络动力学的维度,表明其在皮层计算中具有关键作用。对人类皮层组织(第2-3层)进行了锥体神经元及其单突触连接的多神经元膜片钳记录,样本来自癫痫或肿瘤切除手术。

方法学途径已在先前的技术报告中描述:Peng等,eLife 2019。该数据集的细胞和突触生理学在另一项研究中描述:Planert等,bioRxiv 2023。在本研究中,我们侧重于高阶连接性分析,包括互惠性、方向性和网络模体。我们进一步基于储层计算框架对递归神经网络进行了分析和模拟。我们的分析方法和网络模型的细节在本手稿的补充材料中描述。该存储库包含处理后的数据和代码,用于生成出版物的结果、模拟和可视化。详情请参见Readme文件。,,# 数据来源:人类第2-3层皮层微回路中的有向和无环突触连接性 ## 数据结构 \data文件夹包含预

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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