TCGA-BRCA 集合的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录
基本信息
资源简介
TCGA-BRCA 集合的 DICOM 转换幻灯片显微图像
该数据集英文名为 DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-BRCA collection，对应美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录。用户可通过 IDC Portal 浏览和可视化相应图像，也可利用该记录中包含的清单文件，按照下载说明获取该集合。数据集由 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika、Fedorov, Andrey 共同参与，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年，采用 Creative Commons Attribution 3.0 Unported 许可。本站将其归类为肿瘤 / 其他。
【数据集背景】
该数据集与 TCGA-BRCA 集合相关，属于肿瘤领域中的影像数据资源。其来源站为 doi.org。根据源站描述，该数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或图像衍生数据。该数据集被转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队完成收录。癌症影像计划（CIP）正与参与 TCGA 的机构的主要研究者直接合作，以获取并加载与 TCGA 数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。源站描述还提到，目前该乳腺浸润性癌患者的 MR 多序列图像集合可以通过每个唯一病例标识符，与同一病例来自 The Cancer Genome At 的大量基因和表达数据进行匹配。
【数据内容】
该数据集为 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像，面向 TCGA-BRCA 集合。源站描述指出，该数据集对应一组图像和/或图像衍生数据，并已转换为 DICOM 表示形式。用户可以通过 IDC Portal 探索和可视化相应图像。该记录中包含可用于下载该集合的清单文件。除上述内容外，源站未提供关于图像数量、分辨率、扫描参数、文件大小或具体病例数量的进一步信息。
【采集与来源】
该数据集来源于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC），由 IDC 团队完成 DICOM 转换与收录。癌症影像计划（CIP）与参与 TCGA 的机构的主要研究者直接合作，以获取并加载与 TCGA 数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。源站描述提到，该乳腺浸润性癌患者的 MR 多序列图像集合可通过每个唯一病例标识符与同一病例的基因和表达数据进行匹配。关于具体的采集设备、扫描协议、时间范围或机构分布，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于通过 IDC Portal 浏览和可视化 TCGA-BRCA 相关的 Slide Microscopy 图像。由于源站描述提及其与 TCGA 数据门户中的基因组、临床和病理数据相关，并可通过唯一病例标识符与基因和表达数据匹配，因此适用于需要结合影像与相关基因组、临床或病理信息进行探索的场景。关于具体的分析任务、模型训练用途或临床决策支持场景，源站未提供。
【使用方法】
用户可以使用 IDC Portal 探索和可视化相应图像。该记录中包含清单文件，用户可按照下载说明，利用这些清单文件下载该集合。关于具体的下载步骤、软件环境、数据格式转换细节或访问权限要求，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集已转换为 DICOM 表示形式，并由 IDC 团队收录。源站描述未提供关于数据质量、标注准确性、完整性、偏倚或技术限制的具体信息。关于图像质量、病例覆盖范围、数据缺失情况或使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika、Fedorov, Andrey，机构为 Zenodo，发布时间为 2026 年。许可为 Creative Commons Attribution 3.0 Unported。关于具体的引用格式、DOI 或推荐引用文本，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.22837352
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.1 MB。
数据说明
本数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台（IDC）提供的一组图像和/或源自图像的数据。该数据集已由IDC团队转换为DICOM格式并录入。您可以使用IDC门户网站浏览和可视化相应的图像。您可以使用本Zenodo记录中包含的清单文件，按照下方下载说明下载该数据集。癌症影像计划（CIP）正与参与TCGA的各机构主要研究者直接合作，获取并加载与TCGA数据门户中存储的基因组、临床和病理数据相关的图像。目前，这个乳腺浸润性癌患者的MR多序列图像集可通过每个唯一病例标识符，与来自癌症基因组图谱数据门户中同一病例的大量基因和表达数据进行匹配，以研究临床表型与组织基因组之间的联系。请参阅TCGA-BRCA页面，了解有关这些图像的更多信息，并获取该数据集的任何支持性元数据。
包含的文件 清单文件的名称指示了集合数据某个版本首次引入时所对应的 IDC 数据发布版本。例如，tcga_brca-idc_v22-aws.s5cmd 对应 IDC 数据发布 v22 中引入的 tcga_brca 集合内容。 tcga_brca-idc_v25-aws.s5cmd：AWS 下载清单 tcga_brca-idc_v25-gcs.s5cmd：GCS 下载清单 tcga_brca-idc_v25-dcf.dcf：DCF 下载清单 以 -aws.s5cmd 结尾的清单文件引用 Amazon Web Services (AWS) 存储桶中的文件；以 -gcs.s5cmd 结尾的清单文件引用 Google Cloud Storage 中的文件。实际文件完全相同，并在 AWS 与 GCP 之间镜像。 下载说明 每个清单文件都在其头部包含有关如何下载其中所包含文件的说明。要使用 .s5cmd 清单下载文件： 安装 idc-index：pip install --upgrade idc-index 下载此清单中引用的文件
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
