复发性髓母细胞瘤脑脊液肿瘤促进微环境的多组学研究

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD018226

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓母细胞瘤（MB）细胞起源与特性的分子表征是建立明确分类体系的基础。然而，关于MB肿瘤微环境的数据仍然有限。本文呈现了一项基于质谱的脑脊液（CSF）多组学研究，研究对象为复发性MB患者。一组年龄匹配且无肿瘤性疾病的患者被用作对照队列。蛋白质组谱分析鉴定出若干特征性肿瘤标志物，并揭示MB样本中显著富集以替代性极化髓系细胞为特征的非炎性及促肿瘤蛋白。ADAMTS1、GAP43和GPR37的上调提示MB患者CSF中存在缺氧状态。这一观点得到代谢组学的独立支持，显示色氨酸、甲硫氨酸、丝氨酸和赖氨酸上调，这些氨基酸均已被报道在CSF缺氧条件下被诱导。促进β-氧化的脂质激素12,13-DiHOME被发现强烈上调，可能促进支持MB细胞耐药性和干细胞特性的代谢转变。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。