与文章《食管腺癌预后预测多组学特征定义》相关的数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.7898239

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本记录包含与文章《食管腺癌预后预测的多组学特征定义》相关的原始数据。摘要：食管癌是一种高度致命的恶性肿瘤，占所有癌症死亡人数的5%。该疾病的两种主要亚型为食管鳞状细胞癌（ESCC）和食管腺癌（EAC）。迄今为止，大多数研究集中于分析ESCC的转录谱，仅有少数研究分析了EAC中可能与诊断和/或预后相关的转录特征。在本研究中，我们对来自3例未接受治疗患者的肿瘤组织及配对的非肿瘤组织中富集的CD45+细胞进行了单细胞RNA测序（scRNAseq）分析，以鉴定肿瘤免疫浸润中存在的所有免疫细胞类型及其转录组谱；此外，我们还对23例患者的全转录组进行了分析，这些患者的组织活检取自肿瘤组织及配对的非肿瘤组织。

随后，这两种分析所得的转录特征被用于对更大规模的TCGA EAC患者队列进行分层，显示出与患者预后强烈相关。因此，本文描述的转录特征已证明能够预测患者的临床结局，并可用于更好地界定EAC术后预后，以及指导患者接受有效治疗。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。