结肠癌：3D多细胞肿瘤球体不同区域蛋白质组变化表征
主题标签：结肠癌、3D多细胞肿瘤球体、蛋白质组、肿瘤区域、PRIDE、蛋白质组学。本数据集为肿瘤领域公开数据集，主题涵盖结肠癌。
基本信息
资源简介
结肠癌：3D多细胞肿瘤球体不同区域蛋白质组变化表征
该数据集英文名为“Colon cancer - Characterization of changes in the proteome in different regions of 3D multicell tumor spheroids”，在分类上归属于肿瘤 / 其他，来源于 ebi.ac.uk。其主题围绕结肠癌、3D 多细胞肿瘤球体、蛋白质组、肿瘤区域、PRIDE 与蛋白质组学展开，是一项面向肿瘤研究领域的公开数据集。数据集的核心关注点在于三维多细胞肿瘤球体不同区域中蛋白质组的变化特征，由 Chris Sutton 于 2017 年发布，收录于 PRIDE 归档平台，项目编号为 PRD000369。整体而言，该数据集为研究结肠癌三维培养模型的空间蛋白质组差异提供了公开可获取的数据资源，适合与蛋白质组学、肿瘤微环境及三维细胞模型相关的研究工作参考使用。
【数据集背景】
该数据集聚焦于结肠癌研究中的三维多细胞肿瘤球体模型。与传统的二维细胞培养相比，三维多细胞肿瘤球体能够在空间结构上更接近实体肿瘤的组织特征，其内部不同区域在营养、氧气与代谢物可及性方面存在差异，因而可能呈现不同的蛋白质组状态。数据集标题明确指向“3D 多细胞肿瘤球体中不同区域蛋白质组变化的表征”，说明其研究目的在于刻画球体内部不同空间区域之间蛋白质组构成的差异。该数据集由 Chris Sutton 于 2017 年发布，属于肿瘤领域的公开数据资源，主题涵盖结肠癌与蛋白质组学。
【数据内容】
依据现有信息，该数据集的主题标签包括结肠癌、3D 多细胞肿瘤球体、蛋白质组、肿瘤区域、PRIDE 与蛋白质组学。其内容围绕三维多细胞肿瘤球体不同区域蛋白质组变化的表征展开。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、定量指标、文件格式与数据规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，收录于 PRIDE 归档平台，项目编号为 PRD000369，发布者为 Chris Sutton，发布年份为 2017 年。数据集的正式引用形式为：Chris Sutton (2017). Colon cancer - Characterization of changes in the proteome in different regions of 3D multicell tumor spheroids [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PRD000369。关于具体的实验流程、样本制备方法、质谱平台与仪器参数等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于结肠癌相关研究，尤其是涉及三维多细胞肿瘤球体模型的空间蛋白质组分析。可用于考察球体不同区域之间蛋白质组差异的研究场景，也可作为蛋白质组学数据再利用、方法比较或三维肿瘤模型背景知识梳理的参考资源。由于其归属于肿瘤 / 其他分类，并带有 PRIDE 与蛋白质组学标签，亦适合在蛋白质组学数据检索与归档相关的教学或方法学讨论中作为示例数据引用。关于更具体的适用分析类型或验证用途，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 PRIDE 归档平台的项目页面访问，项目编号为 PRD000369，入口地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PRD000369。使用者可依据该页面获取数据集及其相关说明。关于数据下载格式、文件组织结构、检索方式与分析流程等具体操作细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 PRIDE 归档平台收录的公开数据集，具有明确的发布者、发布年份与项目编号，引用信息完整。其主题限定于结肠癌三维多细胞肿瘤球体不同区域的蛋白质组变化表征。关于数据完整性、鉴定置信度、定量准确性、样本量大小及潜在技术偏倚等质量层面的具体信息，源站未提供。使用者在再利用时应注意结合原始项目页面确认数据适用范围。
【引用与许可】
引用该数据集时，建议采用以下形式：Chris Sutton (2017). Colon cancer - Characterization of changes in the proteome in different regions of 3D multicell tumor spheroids [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PRD000369。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PRD000369
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Chris Sutton（2017）。结肠癌——三维多细胞肿瘤球体不同区域蛋白质组变化的表征［数据集］。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PRD000369
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
