膀胱输尿管反流人尿液蛋白质组数据集

主题标签:膀胱输尿管反流、尿液蛋白质组、泌尿生殖系统疾病、PRIDE、PXD010469。本站分类:泌尿生殖系统疾病/膀胱输尿管反流

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蛋白质膀胱输尿管反流尿液蛋白质组泌尿生殖系统疾病PRIDEPXD010469
Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

膀胱输尿管反流人尿液蛋白质组数据集

Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux 是一个以膀胱输尿管反流为研究背景的人类尿液蛋白质组数据集,收录于 EBI 的 PRIDE 蛋白质组学数据平台,项目编号为 PXD010469。该数据集由 Patricia Cho 于 2018 年发布,主题涵盖膀胱输尿管反流、尿液蛋白质组以及泌尿生殖系统疾病等方向。在本站,它被归入泌尿生殖系统疾病 / 膀胱输尿管反流分类,供关注该疾病及相关蛋白质组学研究的人员检索与使用。整体而言,该数据集以尿液为样本类型,围绕膀胱输尿管反流这一泌尿生殖系统疾病场景组织蛋白质组数据,为相关领域的探索提供了可公开获取的数据资源。

【数据集背景】

膀胱输尿管反流是泌尿生殖系统疾病中的一类常见问题,通常与尿液反流、尿路感染及相关肾脏损伤风险相联系。该数据集以“Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux”为题,将研究对象聚焦于这一疾病背景下的人类尿液蛋白质组。数据由 Patricia Cho 于 2018 年发布,并通过 EBI 的 PRIDE 平台公开,项目编号为 PXD010469。其背景定位明确:以尿液蛋白质组为切入点,服务于膀胱输尿管反流相关的研究需求。本站将其归入泌尿生殖系统疾病 / 膀胱输尿管反流分类,便于在疾病主题下进行检索与归类。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括膀胱输尿管反流、尿液蛋白质组、泌尿生殖系统疾病、PRIDE 与 PXD010469。从名称与主题可以看出,其内容围绕人类尿液样本的蛋白质组展开,属于蛋白质组学数据类型。关于样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、分组设计等具体内容,源站未提供。因此,本数据集在内容层面的可确认信息主要限于其主题范围与数据类型,即膀胱输尿管反流背景下的人类尿液蛋白质组数据。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,具体发布在 PRIDE 蛋白质组学数据平台,项目编号为 PXD010469。源站描述中给出的引用信息为:Patricia Cho (2018). Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010469。关于样本采集的具体流程、受试者来源、样本处理与仪器方法等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与分类,该数据集适用于膀胱输尿管反流相关的尿液蛋白质组研究场景,例如作为该疾病背景下蛋白质组数据的检索入口、用于方法学参考或与其他泌尿生殖系统疾病蛋白质组数据进行比较研究的线索来源。由于具体内容细节源站未提供,其在特定分析任务中的直接适用性需结合原始项目页面进一步确认。

【使用方法】

该数据集通过 PRIDE 平台以项目编号 PXD010469 提供访问,使用者可依据源站给出的项目地址进行检索与获取。关于数据下载格式、文件组织方式、分析流程与推荐工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 PRIDE 平台公开发布,具备明确的项目编号与引用信息,便于定位与引用。其限制在于:关于样本规模、蛋白质鉴定与定量结果、实验设计等具体质量相关指标,源站未提供,因此无法在本介绍中对其数据质量作出进一步判断。使用者应结合原始项目页面核实细节。

【引用与许可】

引用信息为:Patricia Cho (2018). Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010469。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010469

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Patricia Cho (2018). Human Urinary Proteome in Vesicoureteral Reflux [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD010469

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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