内皮细胞与细胞外囊泡响应硫酸吲哚酚的蛋白质组分析数据
内皮细胞与细胞外囊泡响应硫酸吲哚酚的蛋白质组分析：慢性肾脏病中内皮功能障碍的机制[数据集]。主题标签：慢性肾脏病、内皮功能障碍、硫酸吲哚酚、蛋白质组学、细胞外囊泡、内皮细胞
基本信息
资源简介
内皮细胞与细胞外囊泡响应硫酸吲哚酚的蛋白质组分析数据
该数据集为一项蛋白质组学研究的数据集，英文名称为“Data from: Proteomic analysis of endothelial cells and extracellular vesicles in response to indoxyl sulfate: mechanisms of endothelial dysfunction in chronic kidney disease”，来源站为 ebi.ac.uk，本站归类于泌尿生殖系统疾病 / 其他。数据集围绕内皮细胞与细胞外囊泡在硫酸吲哚酚（indoxyl sulfate）刺激下的蛋白质组变化展开，指向慢性肾脏病中内皮功能障碍的机制研究。主题标签涵盖慢性肾脏病、内皮功能障碍、硫酸吲哚酚、蛋白质组学、细胞外囊泡与内皮细胞。该数据集由 Fátima Santos 于 2024 年发布，可通过 PRIDE 归档项目 PXD050628 获取，适合关注慢性肾脏病血管并发症及囊泡介导细胞间通讯的研究者参考使用。
【数据集背景】
慢性肾脏病常伴随血管内皮功能受损，而蛋白结合型尿毒症毒素在其中的作用受到关注。硫酸吲哚酚是慢性肾脏病背景下被研究的毒素之一，内皮细胞与细胞外囊泡对其响应涉及蛋白质层面的改变。该数据集以蛋白质组分析为手段，考察内皮细胞与细胞外囊泡在硫酸吲哚酚作用下的变化，旨在为理解慢性肾脏病中内皮功能障碍的机制提供数据支撑。数据集的主题标签明确指向慢性肾脏病、内皮功能障碍、硫酸吲哚酚、蛋白质组学、细胞外囊泡与内皮细胞等关键词，反映出其研究焦点集中于尿毒症毒素与血管内皮之间的分子联系。
【数据内容】
该数据集为蛋白质组分析数据，涉及内皮细胞与细胞外囊泡两类研究对象在响应硫酸吲哚酚时的蛋白质组信息。数据集英文名称中明确包含“Proteomic analysis of endothelial cells and extracellular vesicles in response to indoxyl sulfate”，表明数据内容围绕内皮细胞和细胞外囊泡在硫酸吲哚酚刺激条件下的蛋白质组展开。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数目、定量结果或差异表达清单等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk，对应 PRIDE 归档项目，项目编号为 PXD050628。源站描述中标注的作者为 Fátima Santos，发布年份为 2024 年。数据集的正式引用信息为：Fátima Santos (2024). Proteomic analysis of endothelial cells and extracellular vesicles in response to indoxyl sulfate: mechanisms of endothelial dysfunction in chronic kidney disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050628。关于样本制备流程、质谱平台型号、色谱条件、实验分组与重复设置等采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于慢性肾脏病相关内皮功能障碍的机制研究，尤其是围绕硫酸吲哚酚这一尿毒症毒素对内皮细胞及细胞外囊泡蛋白质组影响的探索。潜在用途包括：为内皮细胞损伤相关标志物研究提供蛋白质组层面的参考数据；支持细胞外囊泡介导的细胞间通讯研究；作为慢性肾脏病心血管并发症机制研究的辅助数据资源；以及用于蛋白质组学方法在尿毒症毒素研究中的应用参考。具体适用场景应结合源站项目页面所提供的信息判断，源站未提供更细化的适用说明。
【使用方法】
该数据集通过 ebi.ac.uk 的 PRIDE 归档项目页面（项目编号 PXD050628）提供访问。使用者可依据源站描述中的引用信息定位该数据集。关于数据文件的具体格式、下载方式、检索接口、分析流程或配套工具等使用层面的细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 2024 年发布的数据集，来源站为 ebi.ac.uk，具备明确的项目编号与引用信息。关于数据质量评估指标、样本量、技术重复、缺失值情况、数据完整性或验证结果等质量相关信息，源站未提供。使用者在利用该数据集时应结合源站项目页面的说明自行判断其适用范围与局限性。
【引用与许可】
引用该数据集时可采用源站描述中给出的引用格式：Fátima Santos (2024). Proteomic analysis of endothelial cells and extracellular vesicles in response to indoxyl sulfate: mechanisms of endothelial dysfunction in chronic kidney disease [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050628。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050628
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
法蒂玛·桑托斯（2024）。内皮细胞及细胞外囊泡对硫酸吲哚酚反应的蛋白质组学分析：慢性肾脏病中内皮功能障碍的机制[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD050628
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
