结直肠癌队列临床病理数据

数据覆盖结直肠癌患者的临床病理特征,涉及 EMT 相关蛋白、DNA 甲基化水平、E-cadherin、claudin、CD44 基因等主题,可用于分析结直肠癌进展相关的临床病理预后决定因素,支撑预后预测等研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)

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2023-06-09 更新
浏览 2
基因组预测8 EMT-related proteinsrectal cancers showprogressioncolorectal cancer patientsDNA methylation levelclinicopathologic prognostic determ...100AclaudinCRCCD 44 geneE-cadherinclinicopathologic features
Clinicopathologic data of the colorectal cancer cohort.

基本信息

模态
基因组
大小
0.000009728 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-09
版本
v1

资源简介

结直肠癌队列临床病理数据

Clinicopathologic data of the colorectal cancer cohort.

该数据集为结直肠癌队列的临床病理数据,来源于 figshare.com,包含 1 个文件(Table 1.xls),由 Yuan-Chang Dai 等作者于 2021 年 7 月 2 日发布,DOI 为 10.1371/journal.pone.0254000.t001,配套论文发表于 PLOS ONE。数据覆盖结直肠癌患者的临床病理特征,涉及 EMT 相关蛋白、DNA 甲基化水平、E-cadherin、claudin、CD44 基因等主题,可用于分析结直肠癌进展相关的临床病理预后决定因素,支撑预后预测等研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《The correlation of epithelial-mesenchymal transition-related gene expression and the clinicopathologic features of colorectal cancer patients in Taiwan》发表于 PLOS ONE(2021),DOI:10.1371/journal.pone.0254000。源站首次发布:2021-07-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):结直肠癌队列的临床病理数据。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 9.73 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0254000.t001。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:8 EMT-related proteins、rectal cancers show、progression、colorectal cancer patients、DNA methylation level、clinicopathologic prognostic determ...、100A、claudin、CRC、CD 44 gene。本站分类:肿瘤/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Clinicopathologic_data_of_the_colorectal_cancer_cohort_/14901845

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Dai, Yuan-Chang; Fang, Chuan-Yin; Yang, Hsin-Yi; Jian, Yi-Jun; Wang, Shou-Chieh; Liu, Yi-Wen (2021). Clinicopathologic data of the colorectal cancer cohort.. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-09,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table 1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/28695281"

文件清单

  • Table 1.xls(9.73 KB)

文件总体积 9.73 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Clinicopathologic data of the colorectal cancer cohort.

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0254000.t001(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Clinicopathologic_data_of_the_colorectal_cancer_cohort_/14901845)。

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