CDO1基因特异性甲基化在小肠癌中的临床意义数据集
该数据集是一个关于小肠癌表观遗传学的分子与临床数据集，主要数据模态包括基因甲基化定量数据（通过TaqMan甲基化特异性PCR检测CDO1基因）和临床表格信息（如肿瘤直径、病理类型、生存预后等）。它整合了多种小肠肿瘤及结直肠癌的对照样本，旨在研究CDO1基因特异性高甲基化与小肠癌发生、发展的关联，评估其作为新型诊断与预后生物标志物的临床应用价值，为小肠癌的精准医疗提供分子层面的数据基础。
基本信息
资源简介
CDO1基因特异性甲基化在小肠癌中的临床意义数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Clinical significance of cancer specific methylation of the CDO1 gene in small bowel cancer》。配套论文《Clinical significance of cancer specific methylation of the CDO1 gene in small bowel cancer》发表于 PLOS ONE（2019），DOI：10.1371/journal.pone.0211108。源站首次发布：2019-01-24。
【数据内容】
源站原始描述：Although small bowel cancer (SBC) is extremely rare, its prognosis is poor, and molecular mechanism of the SBC development remains unclear. The aim of our study is to elucidate whether DNA methylation of the promoter region of the cancer-specific methylation gene, cysteine dioxygenase 1 (CDO1), contributes to the carcinogenic process in SBC. The study group comprised patients with 53 patients with SBC, 107 colorectal cancer (CRC), and other rare tumors of the small intestine such as 4 malignant…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 96.97 KB。pone.0211108.s001.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，31.29 KB。pone.0211108.s002.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，25.16 KB。pone.0211108.s003.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，40.52 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0211108。
【主题与分类】
源站学科分类：Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。主题标签：ANOVA、CDO 1 methylation status、CRC、ROC、tumor、cancer-specific methylation gene、CDO 1 methylation、CDO 1 methylation level、CDO 1 gene、SBC。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Chemical Sciences not elsewhere classified、Biological Sciences not elsewhere classified、Mathematical Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Clinical_significance_of_cancer_specific_methylation_of_the_i_CDO1_i_gene_in_small_bowel_cancer/7626713
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Kojima, Keita; Nakamura, Takatoshi; Ooizumi, Yosuke; Igarashi, Kazuharu; Tanaka, Toshimichi; Yokoi, Keigo; et al. (2019). Clinical significance of cancer specific methylation of the CDO1 gene in small bowel cancer. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-03，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集聚焦于小肠癌（Small Bowel Cancer, SBC）的表观遗传学研究，通过定量甲基化特异性PCR技术，检测了CDO1基因启动子区域的DNA甲基化水平。数据包含53例小肠癌患者、107例结直肠癌患者以及15例其他小肠肿瘤（4例恶性淋巴瘤、2例平滑肌肉瘤、9例胃肠道间质瘤）的组织样本甲基化数据，并整合了肿瘤直径、预后等临床病理信息。研究旨在探讨CDO1基因的癌症特异性高甲基化在小肠癌发生发展中的作用，评估其作为诊断标志物和预后预测因子的潜力，为小肠癌的分子机制研究和临床管理提供数据支持。
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