肺非结核分枝杆菌病中分枝杆菌群落的特征分析
该数据集包含从肺非结核分枝杆菌病（pNTM）患者和对照者痰样本中获取的基因测序数据，数据模态为基因序列数据，通过hsp65基因部分测序揭示分枝杆菌群落的多样性，主要用于呼吸道感染病原检测、临床微生物组学研究以及非结核分枝杆菌病的诊断方法开发，表明NTM在临床样本中以复杂群落形式存在。
基本信息
资源简介
肺非结核分枝杆菌病中分枝杆菌群落的特征分析
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Profiling mycobacterial communities in pulmonary nontuberculous mycobacterial disease》。配套论文《Profiling mycobacterial communities in pulmonary nontuberculous mycobacterial disease》发表于 PLOS ONE（2018），DOI：10.1371/journal.pone.0208018。源站首次发布：2018-12-11。
【数据内容】
源站原始描述：The diagnosis of pulmonary non-tuberculous mycobacterial disease (pNTM) is dependent on the isolation of NTM in culture, which is prone to overgrowth and contamination and may not capture the diversity of mycobacteria present, including rare or unidentified species. This study aimed to develop a culture independent method of detecting and identifying mycobacteria from sputum samples using partial sequencing of the hsp65 gene. DNA was extracted from sputum samples from subjects with pNTM and dise…
【数据结构与技术规格】
文件数 13 个，合计 2.64 MB。pone.0208018.s001.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，29.64 KB。pone.0208018.s002.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，55.36 KB。pone.0208018.s003.docx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，159.37 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0208018。
【主题与分类】
源站学科分类：Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签：culture、DNA、species、subject、Profiling mycobacterial communities、non-tuberculous mycobacterial disease、nontuberculous mycobacterial disease、hsp 65 gene、sputum samples、diversity。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Profiling_mycobacterial_communities_in_pulmonary_nontuberculous_mycobacterial_disease/7450067
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Cowman, Steven A.; James, Phillip; Wilson, Robert; O. C. Cookson, William; F. Moffatt, Miriam; Loebinger, Michael R. (2018). Profiling mycobacterial communities in pulmonary nontuberculous mycobacterial disease. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
本数据集旨在研究肺非结核分枝杆菌病（pNTM）中的分枝杆菌群落特征。数据集包含从pNTM患者和疾病对照者的痰样本中提取的DNA测序数据，通过针对hsp65基因的部分测序（使用Illumina MiSeq平台和定制引物）进行检测，并构建了hsp65序列参考数据库用于物种分类。数据揭示了分枝杆菌在临床样本中的多样性远高于传统培养方法，表明NTM以群落形式存在而非单一物种。该数据集主要用于呼吸道感染病原检测、临床微生物组学及非结核分枝杆菌病诊断方法的研究。
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