孤立性纤维性肿瘤(中山大学肿瘤防治中心,Nat Commun 2023)

孤立性纤维性肿瘤(Solitary Fibrous Tumors)是该数据集关注的肿瘤类型,在分类上被归入“肿瘤 / 其他”

cbioportal
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基因组分类mixed
cBioPortal: Solitary Fibrous Tumors (SYSUCC, Nat Commun 2023)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

孤立性纤维性肿瘤(中山大学肿瘤防治中心,Nat Commun 2023)

该数据集来源于 cbioportal.org,英文名称为 cBioPortal: Solitary Fibrous Tumors (SYSUCC, Nat Commun 2023),收录了 SYSUCC 孤立性纤维性肿瘤发现队列的靶向测序数据,共涉及131个肿瘤样本,相关成果发表于 Nature Communications(2023年)。

【数据集背景】

孤立性纤维性肿瘤(Solitary Fibrous Tumors)是该数据集关注的肿瘤类型,在分类上被归入“肿瘤 / 其他”。标题中的“SYSUCC, Nat Commun 2023”提示其与一项2023年发表于 Nature Communications 的研究相关联,并对应一个名为 SYSUCC 的发现队列。关于该肿瘤类型的流行病学特征、临床背景以及研究拟解决的具体科学问题,源站未提供。

【数据内容】

根据来源页面的说明,该数据集包含131个孤立性纤维性肿瘤样本的靶向测序结果,这些样本共同构成 SYSUCC 发现队列。数据的主题标注为 mixed。除样本数量、测序类型为靶向测序以及其属于发现队列这些信息外,源站未提供更细粒度的内容说明,例如所覆盖的基因范围、变异类型、临床注释字段、随访信息等。

【采集与来源】

数据发布在 cbioportal.org,来源标题为“Solitary Fibrous Tumors (SYSUCC, Nat Commun 2023)”,对应的文献标识为 pmid:37980418。关于样本的采集地点、采集时间跨度、入组标准、测序平台、建库与分析方法等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集面向肿瘤基因组学相关的研究与分析,可用于围绕孤立性纤维性肿瘤的靶向测序数据开展探索性工作。由于其被描述为发现队列,通常可与后续的验证性分析或独立队列研究相配合。源站未提供针对该数据集的具体适用场景说明或推荐用途。

【使用方法】

该数据集托管于 cBioPortal 平台,该平台一般用于癌症基因组数据的浏览、检索与可视化分析。关于本数据集在平台上的具体访问路径、数据下载方式、文件格式以及操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估结果、质控指标或已知局限的说明。就现有信息而言,其测序类型为靶向测序,样本规模为131例,且被明确描述为发现队列(discovery cohort)。

【引用与许可】

使用该数据集时,应引用其对应的发表成果,文献标识为 pmid:37980418,并关联 Nature Communications(2023)。关于数据许可协议、使用条款与再分发条件,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=sft_sysucc_2023

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

构成SYSUCC发现队列的131例孤立性纤维瘤样本的靶向测序。

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