cBioPortal：BRAF融合 - ARCHER临床测序队列（MSK，Clin Cancer Res 2024）

数据集获取

源站：https://cbioportal.org/study/summary?id=braf_msk_archer_2024

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

通过ARCHER对107例临床病例进行靶向测序，以采用不限瘤种的策略，表征BRAF融合的结构及其对临床病程的影响。本研究是一项更广泛分析的一部分，并得到一项使用MSK-IMPACT测序的平行研究的补充（见相关MSK-IMPACT研究）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。