平滑肌肉瘤cBioPortal数据集
cBioPortal收录的平滑肌肉瘤队列,包含临床和基因组变异信息。由Memorial Sloan Kettering Cancer Center提供,数据格式为表格,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
平滑肌肉瘤cBioPortal数据集
【一句话概览】
该数据集标题为 Leiomyosarcoma(MSK, Clin Cancer Res 2024),来源于 MSK,相关成果发表于 Clin Cancer Res 2024。其原始描述显示,研究通过 MSK-IMPACT 对 470 例平滑肌肉瘤样本及其匹配的正常样本进行了靶向测序。源站标签为 mixed(来源 cBioPortal)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Leiomyosarcoma (MSK, Clin Cancer Res 2024)》。
【数据内容】
源站原始描述:Targeted sequencing of 470 Leiomyosarcoma samples and their matched normals via MSK-IMPACT
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):通过MSK-IMPACT对470例平滑肌肉瘤样本及其匹配的正常样本进行靶向测序。
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:pmid:38488807。
【主题与分类】
主题标签:mixed。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.cbioportal.org/study/summary?id=lms_msk_2024
规范引用:Josephine K et al. Clin Cancer Res 2024
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.cbioportal.org/study/clinicalData?id=lms_msk_2024
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
cBioPortal收录的平滑肌肉瘤队列,包含临床和基因组变异信息。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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