cBioPortal:皮肤黑色素瘤(TCGA,Firehose Legacy)

它同时带有 TCGA 与 Firehose Legacy 的标识,可用于了解该来源站中与皮肤黑色素瘤相关的数据条目。由此可以确认其名称沿革和来源背景与 TCGA、Firehose Legacy、GDAC Firehose 等标识有关

cbioportal
浏览 20
基因组分类skcm
cBioPortal: Skin Cutaneous Melanoma (TCGA, Firehose Legacy)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-06

资源简介

cBioPortal:皮肤黑色素瘤(TCGA,Firehose Legacy)

该数据集的英文名称为 cBioPortal: Skin Cutaneous Melanoma (TCGA, Firehose Legacy),来源站为 cbioportal.org,源站标题为 Skin Cutaneous Melanoma (TCGA, Firehose Legacy),核心主题是皮肤黑色素瘤(Skin Cutaneous Melanoma),主题标签为 skcm,在本站分类中归入肿瘤 / 其他。它同时带有 TCGA 与 Firehose Legacy 的标识,可用于了解该来源站中与皮肤黑色素瘤相关的数据条目。

【数据集背景】

根据来源站描述,该数据集对应 TCGA Skin Cutaneous Melanoma,源数据来自 GDAC Firehose,并且以前称为 TCGA Provisional。由此可以确认其名称沿革和来源背景与 TCGA、Firehose Legacy、GDAC Firehose 等标识有关。至于该数据集最初建立的时间、项目组织方式、版本更新过程、为何由 Provisional 改为当前名称、与其他 TCGA 皮肤黑色素瘤数据集之间的关系,源站未提供。

【数据内容】

从标题和标签来看,该数据集围绕皮肤黑色素瘤展开,主题标签为 skcm,本站分类为肿瘤 / 其他。它可能包含与肿瘤研究相关的数据内容,但具体覆盖哪些数据层面,例如临床信息、样本属性、基因组变异、表达数据、拷贝数变化、病理信息或其他组学内容,源站未提供。数据集包含多少样本、多少患者、多少字段、何种文件格式、是否有数据字典、变量如何命名和编码,源站未提供。因此,无法仅凭现有信息确认其数据内容的详细范围与结构。

【采集与来源】

该数据集的来源站是 cbioportal.org,源站描述明确指出源数据来自 GDAC Firehose。标题中的 TCGA、Firehose Legacy 以及“以前称为 TCGA Provisional”的说明,构成了目前可确认的来源线索。至于原始样本如何采集、由哪些机构完成、是否经过伦理审批、采用何种测序或检测平台、经历了哪些数据处理和质控步骤、Firehose 版本的具体信息、是否经过二次加工或重新注释,源站未提供。

【适用场景】

在肿瘤研究的一般语境中,此类数据集通常可能被用于探索性分析、教学演示、方法验证、跨数据集比较或生物信息学流程测试;与皮肤黑色素瘤相关的主题也可能适合用于该领域的检索和浏览。然而,针对本数据集的具体适用场景、推荐分析类型、是否适合生存分析、突变分析、亚型研究、临床相关性研究或药物靶点探索,源站未提供。其是否能够支持临床决策、诊断用途或治疗指导,源站未提供。因此,使用前需要结合来源站的原始说明判断其适用边界。

【使用方法】

该数据集来自 cbioportal.org,因此访问入口应通过该来源站查找。至于具体如何检索、筛选、下载、调用接口、登录要求、是否需要注册、支持哪些文件格式、是否提供批量下载、是否有版本选择、如何查看数据字典或元数据说明,源站未提供。若需要实际使用,应以来源站对应页面的操作说明为准;本介绍无法给出具体的下载步骤、分析流程或代码示例。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,包括样本量、数据完整性、缺失值情况、批次效应、更新频率、版本差异、已知偏倚、数据校验结果等。Firehose Legacy 与“以前称为 TCGA Provisional”的命名变化是否带来内容差异,源站未提供。其准确性、代表性、可重复性以及是否适合特定研究目的,源站未提供。因此,不能仅凭当前信息判断其质量水平或使用限制,使用前应查阅来源站的原始页面和版本说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的许可协议、引用文献、DOI、使用条款、商业使用规定、再分发要求或署名要求。若需要在论文、报告、产品或教学材料中引用或使用,应以来源站 cbioportal.org 对应页面的原始说明为准。具体引用格式、许可范围和责任限制,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=skcm_tcga

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

TCGA 皮肤黑色素瘤。源数据来自 GDAC Firehose。以前称为 TCGA Provisional。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。