cBioPortal:黑色素瘤(TCGA,Cell 2015)

其核心内容是对333例原发和/或转移性黑色素瘤进行全外显子测序,关联文献标识为 pmid:26091043。以上构成目前可确认的基本轮廓,更细的说明源站未提供

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基因组分类skcm
cBioPortal: Melanomas (TCGA, Cell 2015)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

cBioPortal:黑色素瘤(TCGA,Cell 2015)

该数据集英文名称为 cBioPortal: Melanomas (TCGA, Cell 2015),源站标题为 Mel anomas (TCGA, Cell 2015),发布在 cbioportal.org,主题标签为 skcm,在本站被归入肿瘤/其他类别。其核心内容是对333例原发和/或转移性黑色素瘤进行全外显子测序,关联文献标识为 pmid:26091043。以上构成目前可确认的基本轮廓,更细的说明源站未提供。

【数据集背景】

该数据集以 Mel anomas (TCGA, Cell 2015) 为标题,标题中包含 TCGA 与 Cell 2015 字样。它来自 cbioportal.org,主题标签为 skcm,本站分类为肿瘤/其他。除此之外,关于项目发起背景、研究机构、资助来源、研究目标、样本收集背景、伦理审批信息以及该数据集在更大型计划中的定位,源站未提供。因此,无法从现有信息中进一步还原其研究脉络或历史背景。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集包含对333例原发和/或转移性黑色素瘤进行的全外显子测序。样本类型明确涉及原发和/或转移性黑色素瘤,测序类型为全外显子测序,样本数量为333例。主题标签为 skcm。至于具体的临床字段、突变基因列表、变异注释、拷贝数变异、表达数据、生存信息、样本层级关系、数据文件格式和体积等内容,源站未提供。原发灶与转移灶各自的数量和比例,以及是否包含配对正常样本,源站也未提供。

【采集与来源】

该数据集发布在 cbioportal.org。关联文献标识为 pmid:26091043。关于样本采集地点、采集时间、入组标准、测序平台、文库制备方法、数据产生机构、数据处理流程、伦理审批和共享政策等,源站未提供。因此,现有信息只能确认其来源站点和文献标识,无法进一步说明采集与产生的具体过程。

【适用场景】

源站未提供具体的适用场景、推荐分析方向或预期用途。基于已有描述,可以知道其内容属于黑色素瘤全外显子测序数据,主题标签为 skcm,涵盖原发和/或转移性黑色素瘤。对于需要该类型数据的研究人员,可结合自身研究目的判断是否相关。但该数据集是否适合特定分析、是否包含所需字段、是否支持特定统计或临床解读,源站未提供。

【使用方法】

该数据集发布在 cbioportal.org,但访问入口、检索方式、下载权限、文件格式、是否需要注册、是否提供应用程序接口、可用分析工具以及版本选择方式等,源站未提供。用户若需使用,应前往来源站自行核实可用的访问与下载途径。正式的分析流程、推荐参数和数据准备步骤,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供质量评估、测序深度、覆盖度、样本合格标准、数据完整性、批次效应、更新记录或版本差异等信息。可确认的内容仅限于333例原发和/或转移性黑色素瘤的全外显子测序。原发与转移样本的构成、是否存在重复样本、是否经过统一质控,以及数据缺失情况,源站未提供。使用时应留意这些信息缺口,并结合来源站的最新说明进行判断。

【引用与许可】

源站未提供许可协议、使用条款、引用格式或商业使用限制。关联文献标识为 pmid:26091043,来源站为 cbioportal.org,标题为 Mel anomas (TCGA, Cell 2015)。如需引用或再分发,应以来源站和该文献标识为依据,并自行核实正式引用格式与授权要求。相关许可与引用细节,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=skcm_tcga_pub_2015

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

333例原发性和/或转移性黑色素瘤的全外显子组测序。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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