cBioPortal:转移性黑色素瘤(MSK,JCO Precis Oncol 2017)
该数据集在本站分类中归入肿瘤 / 其他。黑色素瘤是起源于黑色素细胞的恶性肿瘤,转移性黑色素瘤表示肿瘤已超出原发部位。在肿瘤基因组学中,靶向测序常用于在有限范围内检测与肿瘤相关的基因改变

基本信息
资源简介
cBioPortal:转移性黑色素瘤(MSK,JCO Precis Oncol 2017)
cBioPortal: Metastatic Melanoma (MSK, JCO Precis Oncol 2017) 是一个来源自 cbioportal.org 的肿瘤类数据集,源站标题为 Metastatic Melanoma (MSK, JCO Precis Oncol 2017),主题标签为 skcm,聚焦转移性黑色素瘤,包含 66 例治疗前肿瘤样本的靶向测序信息,对应文献标识 pmid:32913971。该数据集在本站分类中归入肿瘤 / 其他。
【数据集背景】
黑色素瘤是起源于黑色素细胞的恶性肿瘤,转移性黑色素瘤表示肿瘤已超出原发部位。在肿瘤基因组学中,靶向测序常用于在有限范围内检测与肿瘤相关的基因改变。cBioPortal 作为癌症基因组学数据门户,通常用于浏览、检索和探索肿瘤样本的基因组数据。该数据集出现在 cBioPortal,标题中带有 MSK 与 JCO Precis Oncol 2017 字样,描述指向治疗前转移性黑色素瘤样本的靶向测序。除这些信息外,关于研究设计、入组标准、治疗背景等背景资料,源站未提供。
【数据内容】
源站描述为 Targeted sequencing of pre-treatment 66 Melanoma tumor samples,即对 66 例治疗前黑色素瘤肿瘤样本进行靶向测序。主题标签为 skcm。数据集英文名和源站标题均为 Metastatic Melanoma (MSK, JCO Precis Oncol 2017)。样本层面的具体字段、检测基因列表、变异类型、临床注释、治疗信息、随访信息、生存终点、是否包含对照样本等内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 cbioportal.org,源站描述写明为治疗前 66 例黑色素瘤肿瘤样本的靶向测序,并标注 PubMed。文献标识为 pmid:32913971。标题中包含 MSK 与 JCO Precis Oncol 2017 字样。关于样本采集地点、采集时间、测序平台、建库方法、测序深度、数据版本、更新记录以及原始数据获取方式,源站未提供。
【适用场景】
在肿瘤基因组学与精准肿瘤学的一般语境中,此类靶向测序数据可用于了解转移性黑色素瘤治疗前样本的基因组改变概况,也可作为探索性分析的起点,例如在 cBioPortal 中查看队列层面的基因改变分布、比较样本间的变异模式,或为后续研究假设提供线索。由于本数据集明确描述为治疗前样本,其主要适用范围应围绕治疗前转移性黑色素瘤的靶向测序信息展开。关于该数据集是否适合特定临床决策、药物响应预测、预后模型训练或跨癌种比较,源站未提供说明,不能仅凭现有描述作出判断。
【使用方法】
该数据集由 cbioportal.org 提供,通常可通过该门户进行访问和浏览;但针对本数据集的具体检索路径、下载方式、筛选条件、数据导出格式、接口调用方法、可视化操作步骤以及是否需要注册或遵守额外访问限制,源站未提供。若使用者在 cBioPortal 中检索该数据集,应以源站页面呈现的样本列表、数据表和下载选项为准。任何分析前,建议先核对样本数量与描述是否一致,并确认所用数据版本。具体操作指南源站未提供。
【质量与限制】
现有信息仅表明该数据集包含 66 例治疗前黑色素瘤肿瘤样本的靶向测序,且主题标签为 skcm。靶向测序通常覆盖范围有限,不等同于全基因组或全外显子测序;因此其能回答的问题会受到检测设计和目标区域限制。样本量为 66 例,属于特定研究队列,不能自动代表所有转移性黑色素瘤人群。除上述内容外,关于数据质量指标、缺失值情况、批次效应、样本合格标准、重复样本处理、变异注释可信度、临床数据完整性及已知局限,源站未提供。使用者应避免超出源站描述范围进行推断。
【引用与许可】
该数据集对应文献标识 pmid:32913971,源站标注 PubMed。引用该数据集或相关研究时,应依据 pmid:32913971 查找正式文献,并按照源站页面的引用要求执行。关于数据许可协议、使用条款、商业使用限制、再分发条件、署名要求以及是否需要获得额外授权,源站未提供。使用者在下载、发表或二次分发前,应自行查阅 cbioportal.org 页面及对应文献中的许可与使用声明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=skcm_vanderbilt_mskcc_2015
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
治疗前66份黑色素瘤肿瘤样本的靶向测序。PubMed
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




