cBioPortal:透明细胞肾细胞癌(DFCI,Science 2019)
它被归入肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org。除标题、分类、来源站和主题标签外,源站未提供关于研究发起机构、研究目的、研究设计、入组标准、时间范围、临床背景或样本选择方式的进一步说明

基本信息
资源简介
cBioPortal:透明细胞肾细胞癌(DFCI,Science 2019)
该数据集在 cBioPortal 中以 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019) 为题提供,完整标识为 cBioPortal: Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),聚焦转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC),包含 35 对肿瘤/正常样本的全外显子测序结果,主题标签为 ccrcc,站内分类为肿瘤 / 其他。
【数据集背景】
该数据集的来源页面标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),标题中包含 DFCI 与 Science 2019 字样。它被归入肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org。除标题、分类、来源站和主题标签外,源站未提供关于研究发起机构、研究目的、研究设计、入组标准、时间范围、临床背景或样本选择方式的进一步说明。
【数据内容】
源站描述指出,该数据为转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的全外显子测序数据,来自 35 对肿瘤/正常样本。主题标签为 ccrcc。除这一描述外,源站未提供关于突变谱、拷贝数变异、基因表达、临床注释、生存信息、治疗信息、样本元数据、测序深度或变异筛选结果的具体内容。因此,当前可确认的核心数据内容是转移性 ccRCC 的肿瘤/正常配对全外显子测序,以及 35 对样本这一规模信息。
【采集与来源】
该数据集来源于 cbioportal.org,来源页面标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),在 cBioPortal 中的完整英文标识为 cBioPortal: Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019)。源站描述说明其采用全外显子测序,研究对象为转移性透明细胞肾细胞癌,样本为 35 对肿瘤/正常配对。相关文献标识为 pmid:29301960。站内分类为肿瘤 / 其他,主题标签为 ccrcc。除上述内容外,源站未提供样本采集地点、测序平台、建库方法、覆盖深度、数据处理流程、伦理审批信息或原始数据获取方式等细节。
【适用场景】
从数据类型看,该数据集围绕转移性透明细胞肾细胞癌的全外显子测序和肿瘤/正常配对样本展开,适用于需要以 ccRCC 肿瘤/正常配对测序数据为对象的肿瘤基因组学研究场景。通用而言,这类数据可用于肿瘤与正常样本比较、体细胞变异发现等方向。但源站未提供该数据集可直接支持的具体分析目标、研究终点、验证结果、推荐软件或分析流程。因此,实际适用场景仍需以 cbioportal.org 对应页面和相关文献的正式说明为准。
【使用方法】
源站未提供该数据集的下载方式、文件格式、访问权限、是否需要注册、数据版本、更新记录或配套分析工具等信息。使用者可前往 cbioportal.org,查找标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019) 的数据集页面,以获取进一步说明。源站未提供关于如何引用数据、如何导入分析工具或如何获取原始测序文件的操作指引。
【质量与限制】
源站描述仅给出 35 对肿瘤/正常样本和全外显子测序,未提供质量评估指标、测序深度、覆盖均一性、污染评估、样本重复、批次效应、临床随访完整性或外部验证结果。因此,无法仅凭现有信息判断数据质量、代表性或适用范围。源站也未提供关于该队列选择偏倚、外推能力、肿瘤样本具体取材部位或正常样本匹配方式的说明。由于样本规模和数据范围有限,使用时应关注源站页面和文献中的正式限制说明。
【引用与许可】
源站给出的相关文献标识为 pmid:29301960。除该标识外,源站未提供标准引用格式、作者列表、期刊卷期页码、许可协议、使用条款、数据再分发限制或商业使用规定。引用或使用该数据集时,应以 cbioportal.org 对应页面以及相关文献的正式信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=ccrcc_dfci_2019
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
35对肿瘤/正常配对样本的转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)全外显子组测序。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




