cBioPortal:透明细胞肾细胞癌(DFCI,Science 2019)

它被归入肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org。除标题、分类、来源站和主题标签外,源站未提供关于研究发起机构、研究目的、研究设计、入组标准、时间范围、临床背景或样本选择方式的进一步说明

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cBioPortal: Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019)

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

cBioPortal:透明细胞肾细胞癌(DFCI,Science 2019)

该数据集在 cBioPortal 中以 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019) 为题提供,完整标识为 cBioPortal: Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),聚焦转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC),包含 35 对肿瘤/正常样本的全外显子测序结果,主题标签为 ccrcc,站内分类为肿瘤 / 其他。

【数据集背景】

该数据集的来源页面标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),标题中包含 DFCI 与 Science 2019 字样。它被归入肿瘤 / 其他类别,来源站为 cbioportal.org。除标题、分类、来源站和主题标签外,源站未提供关于研究发起机构、研究目的、研究设计、入组标准、时间范围、临床背景或样本选择方式的进一步说明。

【数据内容】

源站描述指出,该数据为转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的全外显子测序数据,来自 35 对肿瘤/正常样本。主题标签为 ccrcc。除这一描述外,源站未提供关于突变谱、拷贝数变异、基因表达、临床注释、生存信息、治疗信息、样本元数据、测序深度或变异筛选结果的具体内容。因此,当前可确认的核心数据内容是转移性 ccRCC 的肿瘤/正常配对全外显子测序,以及 35 对样本这一规模信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 cbioportal.org,来源页面标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019),在 cBioPortal 中的完整英文标识为 cBioPortal: Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019)。源站描述说明其采用全外显子测序,研究对象为转移性透明细胞肾细胞癌,样本为 35 对肿瘤/正常配对。相关文献标识为 pmid:29301960。站内分类为肿瘤 / 其他,主题标签为 ccrcc。除上述内容外,源站未提供样本采集地点、测序平台、建库方法、覆盖深度、数据处理流程、伦理审批信息或原始数据获取方式等细节。

【适用场景】

从数据类型看,该数据集围绕转移性透明细胞肾细胞癌的全外显子测序和肿瘤/正常配对样本展开,适用于需要以 ccRCC 肿瘤/正常配对测序数据为对象的肿瘤基因组学研究场景。通用而言,这类数据可用于肿瘤与正常样本比较、体细胞变异发现等方向。但源站未提供该数据集可直接支持的具体分析目标、研究终点、验证结果、推荐软件或分析流程。因此,实际适用场景仍需以 cbioportal.org 对应页面和相关文献的正式说明为准。

【使用方法】

源站未提供该数据集的下载方式、文件格式、访问权限、是否需要注册、数据版本、更新记录或配套分析工具等信息。使用者可前往 cbioportal.org,查找标题为 Clear Cell Renal Cell Carcinoma (DFCI, Science 2019) 的数据集页面,以获取进一步说明。源站未提供关于如何引用数据、如何导入分析工具或如何获取原始测序文件的操作指引。

【质量与限制】

源站描述仅给出 35 对肿瘤/正常样本和全外显子测序,未提供质量评估指标、测序深度、覆盖均一性、污染评估、样本重复、批次效应、临床随访完整性或外部验证结果。因此,无法仅凭现有信息判断数据质量、代表性或适用范围。源站也未提供关于该队列选择偏倚、外推能力、肿瘤样本具体取材部位或正常样本匹配方式的说明。由于样本规模和数据范围有限,使用时应关注源站页面和文献中的正式限制说明。

【引用与许可】

源站给出的相关文献标识为 pmid:29301960。除该标识外,源站未提供标准引用格式、作者列表、期刊卷期页码、许可协议、使用条款、数据再分发限制或商业使用规定。引用或使用该数据集时,应以 cbioportal.org 对应页面以及相关文献的正式信息为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://cbioportal.org/study/summary?id=ccrcc_dfci_2019

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

35对肿瘤/正常配对样本的转移性透明细胞肾细胞癌(ccRCC)全外显子组测序。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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