新诊断神经母细胞瘤或神经节神经母细胞瘤患者肿瘤组织样本中的生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT00904241

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：神经节神经母细胞瘤、局限性可切除神经母细胞瘤、局限性不可切除神经母细胞瘤、区域性神经母细胞瘤、4期神经母细胞瘤、4S期神经母细胞瘤。主要目标：I. 前瞻性分析目前用于风险分组分配的因素（通过荧光原位杂交[FISH]检测的v-myc禽髓细胞瘤病毒致癌基因神经母细胞瘤衍生同源物[MYCN]拷贝数、通过流式细胞术检测的脱氧核糖核酸[DNA]含量，以及使用国际神经母细胞瘤病理分类系统进行的肿瘤组织学检查）在诊断时神经母细胞瘤肿瘤中的情况。II. 维持一个参考库，其中包含在诊断时、二次探查手术时和复发时获得的、具有临床和遗传学特征的冷冻肿瘤组织、肿瘤DNA和核糖核酸（RNA）、组织学切片和石蜡块、神经母细胞瘤衍生细胞系、患者血清和配对正常DNA，以供未来研究使用。III.

前瞻性分析诊断时神经母细胞瘤肿瘤中1p、11q、14q和17q的等位基因状态、通过定量聚合酶链反应（PCR）检测的MYCN拷贝数；以及神经营养因子相关基因的表达模式，并通过逆转录（RT）-PCR检测生物标本中是否存在罕见肿瘤细胞；将这些生物学变量与MYCN扩增、国际神经母细胞瘤分期系统（INSS）分期、年龄、倍体和组织学变量进行比较，分析其在预测治疗反应或结局方面的独立临床意义。IV. 建立治疗研究中患者已知生物学预后因素的数据库。V. 作为神经母细胞瘤患者的登记处，这些患者的肿瘤具有在无辅助治疗情况下定义为治疗失败“低风险”的临床和遗传特征。次要目标：I. 前瞻性分析肿瘤样本中MYCN扩增检测与血清中MYCN DNA定量检测之间的一致性，并分析血清样本中检测到的MYCN扩增的预后意义。II. 建立数据库

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。