α-酮戊二酸维持人癌细胞AMPK翻译的能量感知_靶向代谢物

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS12731

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

能量感受器 AMPK 在应激条件下促进肿瘤细胞存活，但如何阻止 AMPK 激活以减缓肿瘤进展仍不清楚。在此我们表明，代谢物 α-酮戊二酸（α-KG）通过 TET-YBX1 轴控制 AMPK 翻译，可利用这一点使人类癌细胞对能量应激敏感。α-KG 缺陷细胞在葡萄糖饥饿下无法激活 AMPK，进而引起胞质 NADPH 耗竭和细胞死亡。机制上，α-KG 不足会抑制 YBX1 的 TET 依赖性转录，而 YBX1 是人类特异性 AMPK 翻译所需的一种 RNA 结合蛋白。类似地，包括琥珀酸和衣康酸在内的 α-KG 竞争物会抑制 YBX1-AMPK 轴，并使癌细胞对葡萄糖饥饿敏感。最后，共同靶向致癌性 YBX1 和 GLUT1 可产生合成致死效应，并在体内治疗性地减缓肿瘤生长。总之，我们的发现将 α-KG 与通过 AMPK 翻译进行的能量感受联系起来，并提出靶向 α-KG-YBX1 依赖性 AMPK 翻译可使人类癌细胞对能量应激敏感，从而用于治疗。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。