默克尔细胞多瘤病毒VP1与3'-唾液酸乳糖胺复合物结构数据集
该数据集包含默克尔细胞多瘤病毒VP1蛋白与宿主受体3'-唾液酸乳糖胺复合物的三维结构数据,通过X射线衍射技术解析,分辨率达2.0埃,主要应用于病毒-宿主相互作用机制研究、受体识别分析和抗病毒药物靶点发现等结构生物学与病毒学领域。

基本信息
资源简介
默克尔细胞多瘤病毒VP1与3''-唾液酸乳糖胺复合物结构数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Merkel cell polyomavirus VP1 in complex with 3''-sialyllactosamine》。
【数据内容】
源站原始描述:viral capsid protein, jelly roll, encapsidation, receptor binding, sialylated oligosaccharides, VIRAL PROTEIN
【数据结构与技术规格】
数据集 DOI:10.1371/journal.ppat.1002738。
【主题与分类】
主题标签:VIRAL PROTEIN。
【获取与许可】
源站页面:https://www.rcsb.org/structure/4FMI
规范引用:Structures of Merkel Cell Polyomavirus VP1 Complexes Define a Sialic Acid Binding Site Required for Infection. (2012) Plos Pathog
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pdbj.org/mine/summary/4fmi
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集提供了默克尔细胞多瘤病毒(MCV)主要衣壳蛋白VP1与宿主细胞表面受体3’‘-唾液酸乳糖胺(3’'-sialyllactosamine)复合物的高分辨率晶体结构。数据包含原子坐标、配体(氯离子、甘油、N-乙酰神经氨酸等)信息及实验元数据,通过X射线衍射方法在2.0埃分辨率下解析。该结构揭示了病毒与宿主细胞受体的特异性结合机制,为研究默克尔细胞多瘤病毒的感染机制、受体识别及抗病毒药物设计提供了关键结构基础。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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