林奇样综合征患者综合遗传与表观遗传特征相关数据集

该数据集包含123个样本(涵盖林奇综合征、林奇样综合征、散发性病例及健康对照)的全基因组DNA甲基化数据,通过Illumina Infinium MethylationEPIC芯片获取,数据模态为表观遗传学数值矩阵,主要用于研究林奇样综合征的表观遗传特征、探索DNA甲基化模式与疾病关联,并支持肿瘤遗传学和生物标志物开发等研究方向。

1. IRCCS Istituto Romagnolo per lo Studio dei Tumori (IRST) "Dino Amadori", Meldola, Italy1. IRCCS Istituto Romagnolo per lo Studio dei Tumori (IRST) "Dino Amadori", Meldola, Italy
Zenodo
2024-11-14 更新
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林奇样综合征表观遗传学全基因组DNA甲基化分析
Dataset for Comprehensive genetic and epigenetic characterization of Lynch-Like Syndrome patients

基本信息

创建/更新时间
2024-11-14

资源简介

林奇样综合征患者综合遗传与表观遗传特征相关数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Dataset associated with paper "Comprehensive genetic and epigenetic characterization of Lynch-Like Syndrome patients."》。源站首次发布:2024-06-10。

【数据内容】

源站原始描述:Dataset associated with paper "Comprehensive genetic and epigenetic characterization of Lynch-Like Syndrome patients." This set of raw data cannot be made publicy available, but might be made available to interested researcher upon reasonable request. Please forward your request to open.science@irst.emr.it or/and l.calzari@auxologico.it. Description This dataset contains the B-values obtained from the Infinium MethylationEPIC (v1.0) BeadChip analysis for Lynch, Lynch-like, sporadic cases, and co…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.5281/zenodo.11543344。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/11543344

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-11-14,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.11543343

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数据说明

该数据集源自论文《林奇样综合征患者综合遗传与表观遗传特征研究》,包含通过Illumina Infinium Human Methylation EPIC BeadChip芯片分析获得的β值矩阵。数据覆盖林奇综合征患者、林奇样综合征患者、散发性病例及健康对照共123个样本的DNA甲基化信息,涉及740,840个探针。数据来源于外周血淋巴细胞提取的DNA,经过亚硫酸盐转化、芯片杂交、荧光扫描等标准流程,并使用ChAMP软件包进行质量控制、预处理及归一化。该数据集主要用于林奇样综合征的表观遗传机制研究,特别是全基因组DNA甲基化模式分析,可支持肿瘤遗传学、生物标志物发现等研究方向。

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