PRJNA96401：人类淋巴瘤细胞系的微阵列CGH研究
数据围绕人类淋巴瘤细胞系，采用基于微阵列的比较基因组杂交（CGH）技术，用于检测基因组拷贝数变异。BioProject 记录本身是相关生物学数据的集合入口，便于用户集中查找同一项目产生的多种数据类型
基本信息
资源简介
PRJNA96401：人类淋巴瘤细胞系的微阵列CGH研究
PRJNA96401 是一个围绕人类淋巴瘤细胞系展开的生物学项目，其英文名称为“Microarray-based CGH in human lymphoma cell lines.”。该项目采用基于微阵列的比较基因组杂交（CGH）技术，用于检测基因组拷贝数变异，属于肿瘤／淋巴瘤研究范畴。在 NCBI 的 BioProject 体系中，该项目以 Homo sapiens（ID 96401）的形式记录，主题标签为 Variation。BioProject 记录本身并不等同于单一实验数据文件，而是一个相关生物学数据的集合入口，使用户能够集中查找同一项目所产生的多种数据类型，从而了解该项目所涵盖的数据全貌及其来源背景。
【数据集背景】
该数据集对应的是一项关于人类淋巴瘤细胞系的微阵列比较基因组杂交研究。淋巴瘤是来源于淋巴系统的恶性肿瘤，对其细胞系进行基因组水平的变异检测，有助于理解肿瘤基因组的不稳定性。该项目在 NCBI BioProject 中以 Homo sapiens（ID 96401）登记，主题标签为 Variation，表明其关注点在于基因组变异。BioProject 作为一项倡议相关的生物学数据集合，通常由单一组织或联盟发起，并为用户提供一个集中入口，以发现同一项目下不同数据类型之间的链接。该项目的分类归属为肿瘤／淋巴瘤，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
该项目产生的数据围绕人类淋巴瘤细胞系，采用基于微阵列的比较基因组杂交（CGH）技术，用于检测基因组拷贝数变异。主题标签为 Variation，进一步说明数据内容与基因组变异相关。BioProject 记录本身是相关生物学数据的集合入口，便于用户集中查找同一项目产生的多种数据类型。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、细胞系具体名称、变异位点、数据文件格式或数据量的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 96401) - BioProject - NCBI”。项目英文名称为“PRJNA96401: Microarray-based CGH in human lymphoma cell lines.”。BioProject 记录由单一组织或联盟发起，作为一项倡议相关生物学数据的集合。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构或联盟名称，源站未提供。
【适用场景】
基于现有信息，该数据集适用于与人类淋巴瘤细胞系基因组拷贝数变异相关的研究场景，尤其是采用微阵列比较基因组杂交（CGH）技术检测基因组变异的工作。由于 BioProject 记录提供集中查找同一项目多种数据类型的入口，它也可用于数据检索、项目溯源以及关联数据的发现。主题标签 Variation 表明其可服务于变异相关分析。关于具体的疾病亚型、临床关联或药物研究等适用场景，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 96401）访问该项目，并借助 BioProject 提供的集中入口查找同一项目产生的多种数据类型及其链接。项目英文名称“PRJNA96401: Microarray-based CGH in human lymphoma cell lines.”可作为检索标识。关于数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该记录为 BioProject 集合入口，而非单一实验数据文件，因此其本身不直接代表某一具体数据产品的质量指标。关于数据质量评估、技术重复、批次效应、样本量或验证实验等信息，源站未提供。使用时应注意到 BioProject 记录主要提供项目层面的链接与描述，具体数据质量需结合其关联的数据资源进行判断，但源站未提供相关关联资源的细节。
【引用与许可】
关于该数据集的引用格式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA96401
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本系列代表了来自论文（提交待发表）的数据集：“B细胞淋巴瘤中纯合缺失定位新型抑癌基因。Mestre等人。”及其网络补充材料。B细胞非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）发病机制中许多次要事件的分子本质仍不清楚。我们采用高分辨率CGH至BAC微阵列技术，对48株不同来源的B细胞非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）细胞系进行了基因组特征分析。Array CGH平均每株细胞系识别出20处基因组改变，包括区域性的增益和丢失以及先前未表征的异常。在B-NHL各亚型中观察到了不同的基因组模式。为了寻找可能的致癌靶基因，我们在细胞系模型中进行了基因表达谱分析。整合基因组和基因表达分析已在B细胞非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）中识别出扩增的致癌基因，但此类技术在定位纯合缺失内的抑癌基因方面的能力尚未被探索。
基于微阵列的比较基因组杂交（CGH）及基因表达微阵列分析，对源自不同B细胞非霍奇金淋巴瘤（B-NHL）患者的48个细胞系进行研究，在七个染色体区域描绘出二十个纯合缺失，这些区域均包含肿瘤抑制基因靶点。进一步研究显示，仅一部分原发活检样本通过这些基因的点突变或基因内缺失表现出失活，而另一些则常通过表观遗传机制被沉默。我们的微阵列策略识别出了新的候选抑制基因，这些基因因遗传和表观遗传机制而失活，且在不同B-NHL亚型中差异显著。关键词：微阵列CGH，B细胞非霍奇金淋巴瘤，基因组扩增，纯合缺失。总体设计：使用包含2,400个BAC和P1克隆（一式三份）的微芯片，通过微阵列CGH对48个细胞系的DNA拷贝数变化进行全基因组分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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