PRJNA186647:AML 中的染色体碎裂
BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物数据,并提供统一入口以链接该项目产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为 Variation,可用于研究急性髓系白血病中染色体碎裂相关的变异特征,并支持基于这些数据的分类等分析任务(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
PRJNA186647:AML 中的染色体碎裂
PRJNA186647: Chromothripsis in AML 是一个以急性髓系白血病(AML)中染色体碎裂(chromothripsis)为核心研究主题的公开生物项目数据集,收录于 NCBI 的 BioProject 数据库,源站编号为 186647,物种为 Homo sapiens。该数据集在分类上归属于肿瘤 / 白血病方向,主题标签为 Variation,即围绕基因组变异展开。BioProject 记录的设计初衷,是为与单一研究计划相关的生物数据提供集中汇聚与统一入口,使研究者能够从同一位置链接到该项目所产生的多种数据类型。因此,该数据集可用于研究急性髓系白血病中与染色体碎裂相关的变异特征,并支持基于这些数据开展分类等分析任务。整体而言,它面向的是肿瘤基因组变异研究场景,尤其是白血病中复杂基因组重排现象的探索。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是一种生物数据集合,用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据,这些计划可能来自单一组织,也可能来自某个联合体。BioProject 记录的核心价值在于,它为用户提供一个统一的查找位置,以便链接到该项目所生成的多种数据类型。PRJNA186647 这一编号对应的是人类(Homo sapiens)样本,研究焦点为急性髓系白血病中的染色体碎裂现象。染色体碎裂是一种基因组变异形式,而该数据集的主题标签正是 Variation,说明其内容围绕变异特征组织。本站将其归类于肿瘤 / 白血病,进一步明确了其在疾病研究中的位置。对于关注血液系统恶性肿瘤基因组异常的科研人员而言,该数据集提供了一个可追溯、可链接的项目入口。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Variation,表明其内容与基因组变异相关。结合其标题中提到的染色体碎裂,可以判断该数据集涉及急性髓系白血病中染色体碎裂相关的变异特征。BioProject 记录本身并不局限于单一数据类型,而是提供链接以指向该项目产生的多种数据类型。因此,该数据集的内容可能涵盖由该项目生成的不同类型生物数据,但具体包含哪些数据类型、样本数量、测序平台、变异位点数目等细节,源站未提供。该数据集支持基于这些数据开展分类等分析任务,说明其可用于变异模式的识别与归类研究。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心。其源站标题为“Homo sapiens (ID 186647) - BioProject - NCBI”,表明该记录属于 NCBI BioProject 数据库,物种为人类,项目编号为 186647。数据集英文名为 PRJNA186647: Chromothripsis in AML。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体研究机构或联合体名称等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究急性髓系白血病中染色体碎裂相关的变异特征。由于其主题标签为 Variation,可用于变异检测、变异模式分析以及基于变异特征的分类等分析任务。对于肿瘤 / 白血病方向的基因组研究,该数据集可作为项目级入口,帮助研究者定位并链接到该项目产生的多种数据类型。此外,对于关注复杂基因组重排与白血病发生发展关系的科研工作,该数据集也具备参考价值。但具体适用的分析流程、算法或工具,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以 BioProject 记录的形式提供,用户可通过 NCBI 的 BioProject 体系访问,并借助记录中的链接跳转到该项目产生的多种数据类型。使用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关访问规范。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置等操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开的生物项目记录。其质量与完整性取决于原项目提交方所提供的信息。由于 BioProject 记录本身是链接汇聚型入口,具体数据质量需结合其链接到的各数据类型分别评估。该数据集在物种上限定为 Homo sapiens,疾病背景为急性髓系白血病,主题为染色体碎裂相关变异。关于样本量、数据覆盖度、测序深度、质控指标等质量参数,源站未提供。使用者在开展分类等分析任务时,应注意结合具体数据类型的实际情况进行判断。
【引用与许可】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,引用时应遵循 NCBI 及 BioProject 的引用规范,并注明项目编号 PRJNA186647 及标题 Chromothripsis in AML。关于该数据集的具体许可条款、使用限制或授权要求,源站未提供。使用者应自行查阅 NCBI 相关页面以确认适用的引用与许可条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA186647
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含两个急性髓系白血病(AML)样本的数据,这些样本是使用Illumina CytoSNP-12 SNP阵列平台处理的。SNP阵列数据显示这两个样本存在染色体碎裂的证据。在嵌合体样本中,每个缺失存在于相同比例的细胞中,这支持了许多断裂作为单一事件发生的观点。补充的FISH研究强调了在新染色体形成过程中包含了来自不同染色体的着丝粒。总体设计:残留骨髓样本选自常规细胞遗传学检查确定为复杂核型且包含5号和17号染色体异常的患者。
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