人肺癌脑转移相关成纤维细胞全蛋白质组图谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD080067

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症相关成纤维细胞（CAFs）日益被认为是脑转移肿瘤微环境的重要组成部分；然而，其蛋白质组学表型仍缺乏充分表征。本数据集包含基于质谱的蛋白质组学图谱，对象为从肺癌脑转移灶中分离的原代人脑转移相关成纤维细胞（BrM-CAFs）（L-BrM-CAF，n = 3）以及对照的非肿瘤性帽状腱膜下成纤维细胞（Subgalear-NF，n = 3）。全细胞裂解物采用数据非依赖性采集（DIA）质谱进行分析，并辅以由数据依赖性采集（DDA）测量生成的项目特异性谱图库。该数据集旨在表征BrM-CAFs的分子表型，并研究与基质活化、细胞外基质重塑及肿瘤–基质相互作用相关的蛋白质水平改变。这些数据为脑转移微环境和CAF生物学研究提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。