靶向KEAP1失活肺癌中的泛素信号脆弱性

该数据集来自omicsdi.org,聚焦肿瘤/肺癌方向,围绕泛素-蛋白酶体系统(UPS)在肺癌中的治疗依赖性展开。源站描述显示,肺癌细胞依赖蛋白稳态调控因子(尤其是UPS)维持恶性表型,E3泛素连接酶(E3s)和去泛素化酶(DUBs)等UPS组分的遗传改变常见,并形成背景依赖的治疗依赖

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Targeting Ubiquitin Signaling vulnerabilities in KEAP1-Inactivated Lung Cancer

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

靶向KEAP1失活肺癌中的泛素信号脆弱性

该数据集英文名为 Targeting Ubiquitin Signaling vulnerabilities in KEAP1-Inactivated Lung Cancer,在分类上属于肿瘤 / 肺癌方向,来源站为 omicsdi.org。其核心关注点是泛素-蛋白酶体系统(UPS)在肺癌中的治疗依赖性。源站描述指出,肺癌细胞依赖蛋白稳态调控因子,尤其是 UPS,来维持其恶性表型;UPS 组分如 E3 泛素连接酶(E3s)和去泛素化酶(DUBs)的遗传改变较为常见,并会形成背景依赖的治疗依赖。研究者通过 CRISPR 筛选在代谢应激的小鼠肺癌模型中识别出特定癌症脆弱性,其中包括 KEAP1。该数据集围绕 KEAP1 失活肺癌中泛素信号脆弱性展开,主题标签包括 Mouse、Kp、Lung、Kpl、Kpp。

【数据集背景】

肺癌细胞需要依赖蛋白稳态调控网络来维持恶性生长与存活,其中泛素-蛋白酶体系统(UPS)扮演关键角色。UPS 组分,特别是 E3 泛素连接酶(E3s)和去泛素化酶(DUBs),在肿瘤中常发生遗传改变,这些改变可能造成背景依赖的治疗依赖。该数据集聚焦于 KEAP1 失活肺癌背景下泛素信号通路所暴露的脆弱性,试图从蛋白稳态调控角度理解肿瘤形成与治疗依赖。源站描述提到,研究者对代谢应激的小鼠肺癌模型开展 CRISPR 筛选,并识别出包括 KEAP1 在内的特定癌症脆弱性。该数据集即围绕这一研究方向组织,主题标签中的 Mouse、Kp、Lung、Kpl、Kpp 也指向小鼠肺癌相关模型背景。

【数据内容】

该数据集英文名明确指向 KEAP1 失活肺癌中泛素信号脆弱性的靶向研究。源站描述显示,其研究内容涉及肺癌细胞对蛋白稳态调控因子尤其是 UPS 的依赖,以及 E3s 和 DUBs 等 UPS 组分遗传改变如何驱动肿瘤形成并形成治疗依赖。通过 CRISPR 筛选,研究者在代谢应激的小鼠肺癌模型中识别出特定癌症脆弱性,其中包括 KEAP1。主题标签包括 Mouse、Kp、Lung、Kpl、Kpp。除上述信息外,源站未提供更细粒度的数据内容说明,例如具体数据模态、样本数量、筛选文库、测序深度、分析流程或结果文件列表等。

【采集与来源】

该数据集来源站为 omicsdi.org。源站描述指出,研究者在代谢应激的小鼠肺癌模型上开展 CRISPR 筛选,以识别癌症脆弱性。主题标签中的 Mouse 表明研究涉及小鼠模型,Lung 表明组织或疾病背景为肺,Kp、Kpl、Kpp 等标签指向相关模型或实验条件。除这些信息外,源站未提供样本采集地点、时间范围、伦理审批、具体细胞系或动物品系、CRISPR 文库设计、筛选时间点、测序平台等细节。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤 / 肺癌方向的泛素信号与蛋白稳态研究,尤其是围绕 KEAP1 失活肺癌中 UPS 依赖性和治疗脆弱性的探索。潜在使用场景包括:理解 E3 泛素连接酶和去泛素化酶遗传改变如何造成背景依赖的治疗依赖;参考代谢应激小鼠肺癌模型中的 CRISPR 筛选策略;关注 KEAP1 作为癌症脆弱性靶点的研究背景。由于源站描述强调肺癌细胞依赖 UPS 维持恶性表型,该数据集也可用于泛素-蛋白酶体系统与肺癌恶性表型维持之间关系的背景调研。除上述方向外,源站未提供具体的适用分析类型、可支持的药物靶点清单或临床转化场景。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析工具、代码或流程说明等。使用者如需使用,应依据来源站 omicsdi.org 的原始条目获取进一步指引。源站未提供许可条款、访问限制或使用协议信息。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息,例如数据完整性、批次效应、重复性、验证实验、统计功效或错误率等。已知信息仅包括:研究基于代谢应激的小鼠肺癌模型开展 CRISPR 筛选,并识别出包括 KEAP1 在内的特定癌症脆弱性。该数据集的主题标签为 Mouse、Kp、Lung、Kpl、Kpp。由于源站描述较为概括,使用者应注意其结论主要基于源站所述研究背景,具体数据质量与适用范围需参考原始来源。源站未提供其他限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。使用者应访问来源站 omicsdi.org 的对应条目,以获取原始引用与许可要求。源站未提供相关论文标题、作者列表、发表期刊或 DOI 等信息。

下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD067472

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺癌细胞依赖蛋白质稳态调节因子,尤其是泛素-蛋白酶体系统(UPS)内的调节因子,以维持其恶性特性。UPS组分(如E3泛素连接酶(E3s)和去泛素化酶(DUBs))的基因改变十分常见,并产生依赖于具体情境的治疗脆弱性。我们研究了这些变化如何驱动肿瘤形成,对处于代谢应激状态的小鼠肺癌模型进行了CRISPR筛选,并鉴定出特定的癌症脆弱性靶点,其中包括KEAP1。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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