实体瘤自体TCR-T细胞I/II期研究的HLA分型与肿瘤新抗原鉴定

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05124743

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

适应症：卵巢癌、子宫内膜癌、结直肠癌、胆管癌、非小细胞肺癌、胰腺癌。本方案将用于开展和/或收集基因突变检测（例如，在CLIA认证实验室进行的Oncomine™或类似基因组检测）以及由CLIA认证实验室进行的高分辨率人类白细胞抗原（HLA）I类和II类分型的结果。本方案还将收集受试者的临床基线特征、人口统计学资料和癌症病史。本方案将用于监测受试者的疾病状态，以确定符合I/II期研究入组条件的候选人，因为患者必须患有进展性或复发性疾病才能入组该方案。将受试者的体细胞突变与HLA型别限制性组合与Alaunos的TCR库进行比对，以确定是否有适用于该受试者的TCR。无TCR匹配的受试者将退出本方案。

如果受试者的体细胞突变与HLA型别限制组合匹配的TCR在受试者终止后加入Alaunos TCR库，研究者可联系受试者重新筛选以参加研究。在Alaunos TCR库中有TCR匹配的受试者将继续在本方案下随访，其临床状态将持续监测以评估资格，特别是疾病进展或复发，以便在I/II期研究中入组并接受TCR-T细胞治疗。临床状态将在入组时及大约每3个月结合受试者常规标准护理访视进行收集。有TCR匹配的受试者一旦入组I/II期研究或受试者死亡，即完成本方案的参与。当TCR001-201修正案4将HLA分型和肿瘤新抗原筛选纳入治疗方案时，TCR001-002停止招募新参与者。IRB于2023年1月20日批准修正案4，研究中心于2023年2月实施。已在TCR001-002中的参与者的随访于2023年3月23日结束。十九名参与者进入

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。