巨噬细胞糖基化对胆管癌免疫治疗的影响及其预后与免疫微环境意义
该数据集整合了胆管癌的单细胞RNA测序数据、基因共表达网络分析及差异表达基因,主要包含基因表达谱、细胞亚群注释及预后风险评分等多模态数据,旨在构建一个基于巨噬细胞糖基化相关基因的预后模型,用于预测胆管癌患者的生存结局和免疫治疗反应,并探索关键基因PGK1在肿瘤微环境及进展中的功能,为胆管癌的精准治疗和靶点开发提供研究基础。
基本信息
资源简介
该数据集是一个专注于胆管癌(CCA)肿瘤微环境与免疫治疗反应的研究数据集。它整合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据、加权基因共表达网络分析(WGCNA)模块基因以及差异表达基因(DEGs),旨在分析CCA中巨噬细胞亚群的糖基化模式。数据集通过LASSO Cox回归构建了一个基于五个糖基化相关基因(ANXA3, PGK1, PLAUR, CREB5, SPP1)的预后风险模型,用于预测CCA患者的预后和免疫检查点阻断治疗的反应。研究还通过体外实验验证了关键基因PGK1的功能,证实其能促进晚期糖基化终末产物积累、驱动巨噬细胞M2极化,并增强CCA细胞的增殖和迁移。该数据集的主要研究方向是探索肿瘤微环境中糖基化修饰在CCA进展和免疫治疗耐药中的作用,为开发新的预后标志物和治疗靶点提供数据支持。
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数据说明
该数据集是一个专注于胆管癌(CCA)肿瘤微环境与免疫治疗反应的研究数据集。它整合了单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据、加权基因共表达网络分析(WGCNA)模块基因以及差异表达基因(DEGs),旨在分析CCA中巨噬细胞亚群的糖基化模式。数据集通过LASSO Cox回归构建了一个基于五个糖基化相关基因(ANXA3, PGK1, PLAUR, CREB5, SPP1)的预后风险模型,用于预测CCA患者的预后和免疫检查点阻断治疗的反应。研究还通过体外实验验证了关键基因PGK1的功能,证实其能促进晚期糖基化终末产物积累、驱动巨噬细胞M2极化,并增强CCA细胞的增殖和迁移。该数据集的主要研究方向是探索肿瘤微环境中糖基化修饰在CCA进展和免疫治疗耐药中的作用,为开发新的预后标志物和治疗靶点提供数据支持。
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