LC-MSMS分析的人肺癌细胞糖蛋白组

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD010035

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们展示了凝集素-磁性纳米探针与Orbitrap HCD-CID-MS/MS联用，用于糖蛋白质组的互补糖表位特异性富集和位点特异性糖基化分析的实用性。以非小细胞肺癌（NSCLC）细胞为模型，该方法使我们能够比较耐药细胞PC9及其耐药衍生物PC9-IR的糖基化谱。互补富集允许更广泛地靶向不同的糖型；使用Byonic软件，分别对PC9-IR和PC9实现了总共2767和2290个非冗余完整糖肽的可靠鉴定。这也使得无需免疫沉淀即可对癌蛋白EGFR进行糖谱分析。此外，凝集素@MNP提供的糖特异性使我们能够观察到PC9-IR中EGFR的末端和核心岩藻糖基化增加，这证明了耐药细胞系中蛋白质糖基化改变的潜力。基于多凝集素纳米探针的亲和质谱法为不同样品类型的大规模糖蛋白质组分析提供了一种新方法，无需预先分级分离或免疫沉淀。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。