基于功能蛋白质组学的肺癌细胞对法尼基转移酶抑制反应研究(法尼基化蛋白pull-down)
该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题为蛋白质组学。数据基于代谢标记与质谱技术,对多种肺癌细胞系中的法尼基化蛋白进行鉴定,并考察法尼基转移酶抑制剂tipifarnib对法尼基化及细胞功能的影响

基本信息
资源简介
基于功能蛋白质组学的肺癌细胞对法尼基转移酶抑制反应研究(法尼基化蛋白pull-down)
该数据集来自omicsdi.org,属于肿瘤/肺癌分类,主题为蛋白质组学。数据基于代谢标记与质谱技术,对多种肺癌细胞系中的法尼基化蛋白进行鉴定,并考察法尼基转移酶抑制剂tipifarnib对法尼基化及细胞功能的影响。数据集覆盖法尼基化蛋白的全局功能蛋白质组学分析,可用于研究法尼基化修饰的调控机制、评估FTI在肺癌中的功能效应,并为癌症精准医学中的反应预测提供数据基础(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):蛋白质的亚细胞定位可高度动态变化,并受翻译后修饰调控。法尼基化是一种脂质修饰,可使蛋白质锚定于细胞膜,从而实现空间分辨的信号传导与活性。由于法尼基化对细胞功能至关重要,包括tipifarnib在内的法尼基转移酶抑制剂(FTIs)已被开发并正在肿瘤学临床试验中接受测试。目前对FTIs如何影响数百种法尼基化底物的功能影响缺乏了解,这限制了反应预测及其在癌症精准医学中的应用。在此,我们报告了对多种肺癌细胞系中法尼基化及tipifarnib影响的全局功能蛋白质组学研究。该数据集涵盖基于代谢标记的法尼基化蛋白鉴定,采用质谱技术。
【主题与分类】
主题标签:Proteomics、Lung cancer、Human、Farnesylation、Cell line、Lc-ms/ms。本站分类:肿瘤/肺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD050725
下载信息
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源站:https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD050725
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
蛋白质的亚细胞定位可高度动态变化,并受翻译后修饰调控。法尼基化是一种脂质修饰,能使蛋白质锚定于细胞膜,从而实现空间分辨的信号传导与活性。由于法尼基化对细胞功能的重要性,包括tipifarnib在内的法尼基转移酶抑制剂(FTIs)已被开发并正在肿瘤学临床试验中接受测试。目前缺乏关于FTIs对数百种法尼基化底物功能影响的认识,这限制了疗效反应预测及其在癌症精准医学中的应用。在此,我们报告了一项针对多种肺癌细胞系中法尼基化及tipifarnib影响的全局功能蛋白质组学研究。该数据集涵盖了基于代谢标记结合质谱的法尼基化蛋白质鉴定。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




