油酸诱导 HepG2 肝癌细胞增殖的分泌蛋白组图谱

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD007906

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在高增殖性肿瘤中常观察到脂肪酸（FA）增加，这有助于促进肿瘤细胞的增殖。脂肪酸影响肿瘤细胞分泌的因子，这些因子能够调节肿瘤微环境，使之有利于肿瘤生存。然而，受增加的脂肪酸影响的分泌因子尚未被系统地探索。在此，我们对油酸处理和未处理的HepG2细胞进行了全面的分泌组分析。与未处理样本相比，油酸处理样本的分泌组比较鉴定了349个差异分泌蛋白（DSPs；145个上调和192个下调）。DSPs的功能富集和网络分析显示，油酸处理上调的145个分泌蛋白主要与细胞增殖相关过程有关，如脂质代谢、炎症反应和内质网应激。基于DSPs的网络模型，我们选择了四个能够代表与细胞增殖相关过程的表达上调的分泌蛋白（MIF、THBS1、PDIA3和APOA1）。因此，我们的结果提供了一个指示油酸诱导HepG2细胞增殖的分泌组图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。