PLATON——可靶向肿瘤突变分析平台（试点研究）

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04484636

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：肝细胞癌、胆管癌、胆囊癌、胰腺癌、食管癌、胃癌。PLATON（可靶向突变分析平台）旨在改善不同癌种患者的个体化治疗，如肝细胞癌（HCC）、肝内和肝外胆管细胞癌（CCA）、胆囊癌（GBCA）、胰腺癌（PanCa）和食管胃癌（EC/GC），并在其框架内提升治疗指导。理解癌症发生、进展和治疗反应机制的关键，在于将基因突变特征与患病队列的医学和生理数据进行数据整合。

PLATON是一项前瞻性、多中心、观察性队列研究，包含生物样本库建设，不定义任何医学干预，也不评估研究者所做治疗决策的疗效或安全性。在初步方法中，PLATON的试点研究评估胃肠道肿瘤治疗中的基因组图谱分析以及可靶向突变的发生频率，包括肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性状态（MSI），利用Foundation Medicine检测方法对肿瘤标本和EDTA全血样本进行下一代深度测序（NGS）。PLATON试点项目的另一个重要目标是评估是否有患者以及有多少患者基于其基因组图谱接受治疗。该试点研究首先在40个德国研究中心全国范围内招募200名年龄超过18岁的男女参与者。长期愿景是使癌症患者能够获得现有的最佳、有科学依据的、基于生物标志物的诊疗，并针对其个体需求进行定制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。