MetaboLights MTBLS17 - GNPS 利用代谢组学识别肝硬化患者肝细胞癌血清生物标志物
数据通过超高效液相色谱结合混合四极杆飞行时间质谱（UPLC-QTOF MS）比较了 78 例肝细胞癌（HCC）病例与 184 例肝硬化对照的血清代谢物水平，旨在识别用于肝硬化高危人群 HCC 早期检测的候选代谢生物标志物
基本信息
资源简介
MetaboLights MTBLS17 - GNPS 利用代谢组学识别肝硬化患者肝细胞癌血清生物标志物
本数据集为代谢组学数据集，英文名称为 MetaboLights MTBLS17 - GNPS Utilization of Metabolomics to Identify Serum Biomarkers for Hepatocellular Carcinoma in Patients with Liver Cirrhosis，来源于 omicsdi.org，本站分类为肿瘤 / 肝癌，主题标签为 Metabolomics。该数据集的核心目标是通过代谢组学手段，比较肝细胞癌（HCC）患者与肝硬化对照人群的血清代谢物水平，从而识别可用于肝硬化高危人群 HCC 早期检测的候选代谢生物标志物。研究采用超高效液相色谱结合混合四极杆飞行时间质谱（UPLC-QTOF MS）技术，对 78 例 HCC 病例与 184 例肝硬化对照的血清样本进行检测与分析。该数据集为肝癌早期检测、治疗及分子机制研究提供了代谢层面的数据支持。
【数据集背景】
肝细胞癌（HCC）是发生在肝硬化患者中的常见恶性肿瘤，其早期发现对于改善患者预后具有重要意义。在肝硬化人群中，HCC 的发生往往伴随代谢层面的改变，因此通过代谢组学方法表征这些代谢变化，被认为有助于 HCC 的早期检测、治疗以及对其分子机制的理解。本数据集正是在这一背景下产生，旨在利用代谢组学技术探索肝硬化患者中与 HCC 相关的血清代谢标志物，为高风险人群的早期筛查提供潜在的代谢指标依据。
【数据内容】
该数据集包含通过超高效液相色谱结合混合四极杆飞行时间质谱（UPLC-QTOF MS）获得的血清代谢物检测数据。研究比较了 78 例 HCC 病例与 184 例肝硬化对照的血清代谢物水平。基于质谱分析，研究识别出若干候选代谢生物标志物，这些标志物可用于肝硬化高危人群中 HCC 病例的早期检测。数据集的主题标签为 Metabolomics，本站分类为肿瘤 / 肝癌，整体内容围绕肝癌与肝硬化相关的血清代谢特征展开。
【采集与来源】
该数据集下载自 MetaboLights（http://www.ebi.ac.uk/metabolights/），其登录号为 MTBLS17。数据来源站为 omicsdi.org。原始研究使用超高效液相色谱结合混合四极杆飞行时间质谱（UPLC-QTOF MS）对血清样本进行代谢物水平检测。样本包括 78 例 HCC 病例与 184 例肝硬化对照。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及样本处理流程的更多细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肝癌尤其是肝细胞癌相关的代谢组学研究，可用于探索肝硬化高危人群中 HCC 早期检测的候选代谢生物标志物。其潜在应用方向包括：肝癌早期筛查标志物的发现与验证、肝硬化向 HCC 进展过程中的代谢变化研究、以及基于血清代谢谱的 HCC 分子机制探索。此外，该数据集也可作为代谢组学方法在肿瘤标志物研究中应用的参考数据。关于该数据集在其他具体场景中的适用性，源站未提供更多说明。
【使用方法】
该数据集可通过 MetaboLights 平台获取，登录号为 MTBLS17。使用者可依据代谢组学常规分析流程，对 UPLC-QTOF MS 产生的质谱数据进行处理与解读，以比较 HCC 病例与肝硬化对照之间的血清代谢物水平差异，并进一步评估候选代谢生物标志物的潜在价值。关于数据的具体格式、预处理步骤、分析软件及参数设置等操作细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于 78 例 HCC 病例与 184 例肝硬化对照的血清样本，采用 UPLC-QTOF MS 技术进行检测，并识别出若干候选代谢生物标志物。关于样本量是否充分、是否存在批次效应、数据缺失情况、验证队列信息以及研究的具体局限性，源站未提供。使用者在使用该数据集时，应结合自身研究目的对数据适用性进行评估。
【引用与许可】
该数据集来源于 MetaboLights，登录号为 MTBLS17，来源站为 omicsdi.org。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款及版权信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000080944
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本数据集下载自MetaboLights（http://www.ebi.ac.uk/metabolights/），登录号为MTBLS17。摘要：表征肝硬化患者中与肝细胞癌（HCC）相关的代谢变化，被认为有助于HCC的早期发现、治疗及对其分子机制的理解。我们采用超高效液相色谱结合混合四极杆飞行时间质谱（UPLC-QTOF MS），比较了78例HCC病例与184例肝硬化对照者血清中的代谢物水平。利用质谱技术，我们识别出若干候选代谢生物标志物，用于在肝硬化患者这一高风险人群中早期检测HCC病例。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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