GNPS 代谢组学与脂质组学筛选揭示非酒精性脂肪性肝炎向癌症发展的重编程信号通路
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/肝癌分类，主题为代谢组学。研究利用 LC MS/MS 技术，对非酒精性脂肪性肝炎（NASH）及 NASH 相关肝细胞癌（HCC-NASH）患者的代谢指纹进行解析，描绘了从 NASH 向 HCC 发展过程中最显著的重编程代谢通路图谱
基本信息
资源简介
GNPS 代谢组学与脂质组学筛选揭示非酒精性脂肪性肝炎向癌症发展的重编程信号通路
该数据集聚焦于非酒精性脂肪性肝炎（NASH）向肝细胞癌（HCC）演进过程中的代谢重编程问题，属于肿瘤/肝癌分类下的代谢组学资源。研究借助液相色谱-串联质谱（LC MS/MS）技术，对NASH患者以及NASH相关肝细胞癌（HCC-NASH）患者的代谢指纹进行解析，旨在揭示从NASH向HCC发展过程中最为显著的重编程代谢通路图谱。非酒精性脂肪肝病目前被视为最常见的慢性肝病形式，它是一种复杂的代谢性疾病，会悄然进展为非酒精性脂肪性肝炎，而NASH正是细胞周围纤维化、肝硬化及肝细胞癌的关键转折点。尽管该疾病具有复杂的代谢属性，但究竟哪些代谢读出信号在推动代谢通路持续运转、进而促进HCC从NASH进展的过程中发挥作用，目前仍未得到充分理解。该数据集正是围绕这一未解问题，提供了NASH与HCC-NASH患者的代谢层面信息，并描绘了靶向HCC发展的主要重编程代谢通路。
【数据集背景】
非酒精性脂肪肝病已成为当前最常见的慢性肝病形式，其本质是一种复杂的代谢性疾病，能够在无明显症状的情况下逐步进展为非酒精性脂肪性肝炎。NASH被视为细胞周围纤维化、肝硬化以及肝细胞癌的临界转折点。尽管NASH属于代谢性疾病，但关于哪些代谢读出信号在代谢通路的持续运行中发挥作用、并推动HCC从NASH阶段进一步发展，目前的认识仍不完整。该数据集正是在这一背景下产生，试图通过代谢组学与脂质组学筛查手段，揭示NASH及HCC-NASH患者体内发生的代谢重编程，为理解从NASH向HCC演进的代谢机制提供线索。
【数据内容】
该数据集的主题标签为代谢组学（Metabolomics），其核心内容涉及NASH与HCC-NASH患者的代谢指纹。研究利用LC MS/MS技术，对上述患者群体的代谢特征进行解析，并绘制出从NASH向HCC发展过程中最占主导地位的重编程代谢通路的详细图谱。数据集所关注的是代谢层面的读出信息，而非单纯的基因组或转录组信息，因此其内容侧重于代谢物水平的变化及其所反映的通路重编程。关于样本数量、代谢物具体种类、通路名称清单、统计指标等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org。其英文名称为“GNPS - Metabolomics and Lipidomics Screening Reveal Reprogrammed Signaling Pathways toward Cancer Development in Non-Alcoholic Steatohepatitis”。研究采用LC MS/MS作为分析技术，对NASH和HCC-NASH患者的代谢指纹进行采集与解析。源站描述中提及了相关文献的DOI标识（https://doi.org/10.3390/ijms24010210），可作为进一步获取原始研究信息的入口。关于样本采集地点、采集时间、样本量、伦理审批信息等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于代谢组学与脂质组学相关的研究场景，尤其适合关注非酒精性脂肪性肝炎向肝细胞癌演进过程中代谢重编程机制的研究者。其潜在应用包括：探索NASH与HCC-NASH患者之间代谢指纹的差异；识别在NASH向HCC发展过程中显著重编程的代谢通路；为肝癌发生发展的代谢机制研究提供数据参考；以及作为代谢组学筛查方法在肝脏疾病进展研究中的应用示例。此外，该数据集也可用于方法学层面的参考，例如LC MS/MS在临床代谢组学与脂质组学筛查中的使用。关于具体的分析软件、统计方法或验证实验设计，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过omicsdi.org获取，具体下载方式、文件格式、数据组织结构和访问权限等，源站未提供。使用者可依据源站描述中给出的DOI链接查阅相关研究文献，以了解研究设计、分析流程和结果解读方式。由于数据集涉及NASH与HCC-NASH患者的代谢指纹，使用时应结合代谢组学与脂质组学的通用分析流程进行数据处理，例如代谢物鉴定、通路富集分析和差异代谢物筛选等。关于是否需要特定软件、是否提供原始数据或处理后数据、是否附带分析代码等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于LC MS/MS技术获取代谢指纹，并描绘了从NASH向HCC发展过程中最显著的重编程代谢通路图谱，其来源为omicsdi.org，并关联了同行评议文献的DOI。然而，关于样本量、队列构成、是否包含对照组、代谢物覆盖度、定量准确性、批次效应控制、数据完整性以及可重复性等质量相关指标，源站未提供。此外，该数据集是否涵盖脂质组学的具体脂质种类、是否提供临床元数据、是否经过独立验证等，源站亦未提供。因此，在使用该数据集时，应结合原始文献对上述限制进行核实。
【引用与许可】
该数据集关联的文献DOI为https://doi.org/10.3390/ijms24010210，引用时应参考该文献。关于数据集的许可协议、使用条款、是否允许再分发或商业使用等信息，源站未提供。使用者应访问omicsdi.org或查阅相关文献以获取准确的引用格式与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/gnps/MSV000088003
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
非酒精性脂肪性肝病目前被认为是慢性肝病中最常见的形式。它是一种复杂的代谢性疾病，会悄然进展为非酒精性脂肪性肝炎（NASH）。事实上，NASH是细胞周围纤维化、肝硬化和肝细胞癌（HCC）的转折点。尽管它是一种复杂的代谢性疾病，但对于在从NASH向HCC进展过程中发挥代谢途径持续作用的代谢读数，其识别仍未完全明了。借助LC MS/MS，本研究揭示了NASH和HCC-NASH患者的代谢指纹，并描绘了一幅详细图谱，展示了从NASH靶向HCC发展的最主要重编程代谢途径。https://doi.org/10.3390/ijms24010210
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
