H&E染色口腔鳞状细胞癌组织学图像数据集

该数据集是一个包含1020张H&E染色口腔鳞状细胞癌组织学图像(图像模态)的医学图像集合,提供了肿瘤区域和正常组织的手动标注,主要用于支持计算机视觉和深度学习在口腔癌区域自动分割及计算机辅助诊断方面的研究,旨在解决该领域标注数据缺乏的问题。

联邦大学乌贝兰迪亚分校联邦大学乌贝兰迪亚分校
arXiv
2023-01-14 更新
浏览 22
口腔癌计算机视觉
H&E Stained Oral Squamous Cell Carcinoma Histology Image Dataset (OCDC)

基本信息

大小
0.02 GB
创建/更新时间
2023-01-14
版本
v1

资源简介

H&E染色口腔鳞状细胞癌组织学图像数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《H&E-stained oral squamous cell carcinoma histological images dataset》。源站首次发布:2022-12-28。

【数据内容】

源站原始描述:Computer-aided diagnosis (CAD) can be used as an important tool to aid and enhance pathologists'' diagnostic decision-making. Deep learning techniques, such as convolutional neural networks (CNN) and fully convolutional networks (FCN), have been successfully applied in medical and biological research. Unfortunately, histological image segmentation is often constrained by the availability of labeled training data once labeling histological images for segmentation purposes is a highly-skilled, comp…

【数据结构与技术规格】

文件数 2459 个,合计 1.08 GB。数据集 DOI:10.17632/9bsc36jyrt.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/9bsc36jyrt

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/9bsc36jyrt/1

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是由联邦大学乌贝兰迪亚分校创建的口腔鳞状细胞癌组织学图像数据集,包含1020张尺寸为640x640像素的H&E染色组织学图像。数据集内容涵盖肿瘤区域和正常组织的手动标注图像,数据来源于口腔和颌面病理学部门的临床档案。在构建过程中,使用Slide Scanner Aperio AT2扫描仪在20倍放大倍数下捕获全切片图像,并从中随机提取图像补丁进行专业病理学家的手动标注。该数据集主要应用于口腔癌的计算机视觉研究,特别是用于解决标注训练数据缺乏的问题,支持深度学习模型在口腔癌区域自动分割和计算机辅助诊断中的应用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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